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解决方案 | 生殖遗传NGS检测产品助力出生缺陷防控

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2024-05-15T00:00 (访问量:15072)

 

2024年1月开始,生殖遗传领域逐步迎来一系列里程碑事件,四篇携带者筛查领域方向的专家共识齐发,共同支持携筛的临床应用转化。多家检测公司的遗传NGS检测试剂盒相继获批上市,生殖遗传检测加速迈进“证”时代,大大拓展了NGS技术应用于产前诊断的范围,更标志着NGS技术在我国出生缺陷防控体系建设中又迈出了关键一步。

 

 

2024年1月11日,安诺优达CNV-seq产品获批,可以同时检测羊水样本中染色体非整倍体及CNV变异,填补国内空白;

 

2024年2月21日,华大基因CNV-seq羊水检测试剂盒获医疗器械注册证,继2022年CNV-Seq流产组织检测获证后持续为出生缺陷防控开启新的篇章;

 

2024年3月21日,贝瑞基因“染色体拷贝数变异检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”获国家药品监督管理局(NMPA)批准上市。

 

2024年4月11日,杰毅麦特基于微阵列芯片技术(CMA)的染色体拷贝数变异检测试剂盒正式获批NMPA注册证。

 

 

生殖遗传NGS检测常见类别

 

类别

无创产前基因检测-NIPT

基因组拷贝数变异测序技术-CNV-seq

全外显子测序-WES

全基因组测序-WGS

胚胎植入遗传学检测检测(PGT-A、PGT-M、PGT-SR)

携带者筛查NGS检测

样本类型

孕妇外周血

羊水、绒毛、脐带血、流产组织、外周血

基因组DNA样本、全血、组织样本等

血液、组织、羊水等

胚胎细胞,囊胚期外滋养层细胞

外周血、胚胎细胞

检测范围

全染色体非整倍体

全染色体非整倍体、大片段缺失/重复及全基因组CNVs

染色体数目异常、拷贝数变异(CNV)、单个碱基的变异(SNV) 和小片段的插入/缺失变异(indel)

全染色体非整倍体、家系已知单基因遗传病、染色体结构异常(易位、倒位等)

常染色体隐性遗传病、X连锁遗传病和常染色体显性遗传病。

适应症

常规产筛项目,孕妇为主

流产、死胎或死产胎儿组织需明确遗传学病因者;有介入性产前诊断指征或需求的孕妇

临床无法确诊,高度怀疑遗传病的患者;有单基因遗传病家族史的人群;具有明显家族史,但不清楚为何种疾病的患者;不明原因发育迟缓、智力低下等精神状态异常的患者;临床高度怀疑是基因突变导致的疾病等

反复移流产及高龄女性;夫妇双方均为同一常染色体隐性疾病的致病基因携带者等。

有亲属存在高度疑似遗传性疾病的情况;关注子代健康,有生育意愿夫妇等

 

 

 

生殖遗传NGS检测产品解决方案

 

方案1. 单细胞全基因组扩增+高效率酶切建库,助力PGT检测更精准

Hieff NGS® Single Cell/Low Input WGA Kit(Cat#12510)+Hieff NGS® C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit(Cat#13570)

 

 

性能展示:

建库试剂盒

DNA样本和投入量

建库条件

接头

循环数

12570+酶切建库13570

WGA产物

投入量100 ng

打断30度25 min,加A 20min,接头连接15 min

MGI接头

6cycle

性能表现

 

 

方案2. cfDNA提取+高产DNA建库,实现无创产前DNA检测更高效

MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit(Cat# 18382ES)+Hieff NGS® DNA Library Prep Kit(Cat#12927)

 

建库流程

 

性能展示

试剂盒

样本

实验条件

循环数

建库12927

cfDNA样本

 

投入量0.1-5 ng,搭配Illumina 长接头,接头连接后1.0×纯化,文库扩增15 cycle,扩增产物0.8/0.15×分选。

15 cycle

性能表现

 

方案3. 一款产品多功能,同步实现WGS、WES和CNV-seq检测

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)

 

 

性能展示

试剂盒

样本和投入量

实验条件

循环数

建库试剂12194

标准品:NA12878样本500 ng

打断时间15 min;接头连接后0.3/0.1×分选;扩增产物0.9 ×纯化

7 cycle

性能表现

 

 

方案4.全外显子捕获试剂,为生育健康保驾护航

Hieff NGS® Human All Exon Probes(Cat#12244)

 

建库流程

 

性能展示

试剂盒

样本和投入量

实验条件

循环数

建库试剂12194+捕获探针12244

标准品:NA12878样本500 ng

全外显子组探针进行杂交捕获:1)illumina和MGI文库构建测序检测;2)不同厂家WES捕获试剂测试;3)批次间稳定性数据;5)过夜杂交和快杂效果一致性测试

7 cycle

性能表现

 

 

方案5.多重PCR扩增,实现常见已知位点精准检测

2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix(Cat#13283)

 

性能展示

试剂盒

样本

实验条件

循环数

多重试剂13283

人gDNA样本

1)搭配人源10重panel,30 μl体系,评测扩增均一性情况;                            2)人gDNA 10 ng,搭配热点基因Panel 200重左右,评测测覆盖度情况。

20-30cycle

性能表现

 

 

生殖遗传领域,产品上市逐步“常态化”,是行业走向规范、走向成熟的重要标志。翌圣多种生殖遗传检测试剂盒满足众多客户的不同需求,助力出生缺陷防控检测更精准、更便捷!

 

 

 

生育健康NGS检测产品选择指南

 

产品

产品名称

货号

NIPT项目

cfDNA提取

MolPure® Magnetic Cell-Free DNA Kit 磁珠法游离DNA提取试剂盒

18382ES

DNA机械法建库

Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 全能型DNA建库试剂盒

13577ES

DNA机械法建库

Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 2.0 全能型DNA建库试剂盒2.0

12927ES

PGT项目

单细胞全基因组扩增

Hieff NGS® Single Cell/Low Input WGA Kit

12510ES

酶切法建库

Hieff NGS® C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit

13570ES

多重PCR扩增预混液

2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix

13283ES

遗传病检测

血液gDNA提取

MolPure® Magnetic Blood DNA Kit 磁珠法血液 DNA 提取试剂盒

18504ES

DNA酶切建库

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3

12194ES

WES捕获系列

Hieff NGS® Human All Exon Probes

12244ES

Hieff NGS® Hyb & Wash Kit

12245ES

Hieff NGS® Universal Blocking Oligo (with cot-1)

12246ES

Hieff NGS® Universal Post PCR Primer for Illumina

12247ES

Hieff NGS® Hyper Enrichment Beads

12248ES

 

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