品质升级丨统计基因组学培训会又双叒来啦!

来源: 北京博奥晶典生物技术有限公司   2018-10-26   访问量:850评论(0)

 

统计基因组学培训会又双叒来和大家见面了,

2018年培训会品质升级,新增多位外籍专家,

国际专家交流 + 高端生信培训 + 国外学习机会

这是一个怎样的培训会?

您是否已经心怀期待?

不要着急,全新升级的培训会详情为您奉上!

2018年统计基因组学培训会

2018 Statistical Genomics Workshop

培训会特色

权威的讲师团队

培训专家来自中国科学院院士,哈佛大学医学院、美国Broad研究院的华裔和外籍专家,国内著名高校教授!这些专家所在研究组在国际上率先开发出了Haploview,PLINK, GATK等目前遗传学分析、全基因组关联、二代测序等常用软件。且大多在Nature、Science等顶级期刊发表过研究论文!

丰富的培训内容

本次培训为高端生物信息系列培训,内容是关于基因组学及NGS数据分析的综合性培训!包括基因组、转录组、表观基因组和癌症基因组里面常见和最新的分析方法!全程中英文讲解,理论讲授和上机操作搭配进行!

拥有福利的学习机会

这是一次与国际最顶尖专家零距离交流与学习的难得机会!参加培训班的学员可以现场与讲课老师交流,更有去国外交流学习的机会!

培训会详情

 

 

 

 

☆ 联合主办单位:

北京博奥晶典生物技术有限公司

北京市科学技术研究院

北京市计算中心

北京新抗元生物技术有限公司


☆ 协办单位:

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会


 

 

☆ 培训时间:

2018年10月29日—2018年11月02日

 

 

 

☆ 培训地点:

北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心


 

 

授课老师

 

授课老师

授课老师单位

于军

中国科学院北京基因组研究所

许益祥

美国哈佛医学院,哈佛公共卫生学院

黄海亮

美国哈佛医学院,麻省总医院

Lori Chibnik

美国哈佛医学院,美国哈佛公共卫生学院

李婉萍

短序列比对软件MOSAIK的发明人

徐书华

中国科学院特聘研究员,中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所

杨怀一

中央研究院基因体研究中心

Chia-Yen Chen

Harvard School of Public Health

Anne Feng

————————

周一鸣

北京新抗元生物技术有限公司创始人

 

培训会日程表

 

Date

Time

Instructor

Topic

2018/10/29Day1

8:30-9:00

 

Registration

9:00-9:30

Yubao Chen
 YiMing Zhou

Hailiang Huang

Opening  remarks and introduction to the workshop

9:30-10:30

于军

待定

10:50-12:00

Hailiang Huang

Genetics of  human complex disorders

1:00-2:30

Hailiang Huang

Genetic  association studies (quality control, common variant association studies,  meta-analysis)

2:50-5:00

Anne Feng

Hand-on:  genetic association studies

       

2018/10/30Day2

9:00-10:30

Chia-Yen Chen

Common variant  heritability and genetic correlation

11:00-12:30

Chia-Yen Chen

Conducting  studies using public resources and biobanks

1:30-3:00

Wan-Ping Lee

Introduction  to NGS technology and platforms

3:30-5:00

Wan-Ping Lee

NGS clinical  practice

       

2018/10/31Day3

9:00-10:30

Wan-Ping Lee

Variant  annotation

11:00-12:30

Shuhua Xu

Primer on  population genetics

1:30-3:00

Shuhua Xu

Phylogenetic  tree and population structure analysis

3:30-5:00

Lori Chibnik

Introduction  to Alzheimer’s disease

       

2018/11/1Day4

9:00-10:30

Hwai-I Yang

Liver  biomarker studies

11:00-12:30

Anne Feng

Exome-sequencing  analysis in scale

1:30-3:00

Lori Chibnik

Study design,  multiple resting, power and sample size estimate

3:30 – 5:00

All Instructor

Panel discussion

       

2018/11/2Day5

9:00-10:50

Yiming Zhou

Cancer genome  analysis for precision medicine

11:00-12:30

Yi-Hsiang Hsu

Database,  Biobanks and Online Resources:

TopMed, TCGA,  GTEX, UKBIOBANK, etc….                

1:30-3:00

Yi-Hsiang Hsu

Functional  Genomics: Functional annotation, Functional SNP and Targeted Gene Prediction,  Chromatin accessibility, TF binding footprint, ATAC-seq

3:30-5:00

Yi-Hsiang Hsu

Cancer Genomics: Somatic Mutation and Neoantigen

报名费用

 

 

乘车路线

【公交路线】365 路、570 路到丰贤中路站,438路到丰贤路口南站(下车后需沿丰贤中路步行 700 米)到达“北京科学技术研究院现代制造技术产业园(简称‘北科产业’),工作日期间,园区门口会停放班车。

【地铁路线从4号线西苑站换乘16号线到永丰站下车,B口出,沿永盛北路直行,拐至丰贤中路上,步行约12min。

授课老师简介

杨怀一教授,2006年于台湾大学公共卫生学院流行病学研究所取得博士学位。2006 - 2011年在中央研究院基因组研究中心进行博士后研究。2011-2013年为中国医药大学临床医学研究所副教授和中国医药大学附设医院分子与基因体流行病学研究中心副研究员。2013年至今为中央研究院基因体研究中心副研究员,并为国立阳明大学临床医学研究所副教 授。

杨怀一教授的研究方向有: (1) 使用纵向随访研究描述慢性乙型和丙型自然病史中里程碑转变和疾病进展的发生率和决定因素。(2) 开发和验证风险预测工具,其中纳入了多个非侵入性临床参数,用于预测慢性乙型和丙型肝炎的标志物转换和相关末期肝疾。(3) 使用高通量分子和基因组技术,包括全基因组关联研究,下一代测序,多重蛋白质测定和聚糖阵列,研究病毒和宿主免疫因素对病毒性肝炎的重要作用。(4) 探索有用的基因组,蛋白质组和糖基预诊断生物学特 征,用于预测主要癌症,以开发癌症早期诊断和癌症预防性疫苗的新策略。

 

徐书华, 中国科学院特聘研究员,中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究组长、博士生导师,兼任上海科技大学特聘教授;2012年起担任德国马普学会与中科院共同支持的马普青年科学家小组组长。2013年入选国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”;2015年获国家杰出青年基金;2016年入选上海市优秀学术带头人;兼任上海市遗传学会常务理事、上海市人类学会理事、中国遗传学会青年委员会委员、Molecular Genetics and Genomics(德国)编委、Human Genomics(英国)编委、Hereditas(英国)编委、Genesand Genetic Systems(日本)编委、Scientific Reports(英国)编委、BMC Genetics (英国)编委(Section Editor)。长期致力于群体基因组学研究,专注于人类遗传和微观进化问题;发展和运用群体基因组学方法和计算生物学手段在人群的遗传结构、环境适应和微观进化机制研究方面取得了系统性的成果。目前担任国家自然基金委重大研究计划集成项目和重点项目负责人、中科院先导专项(B类)项目负责人。在Science,PNAS,AJHG等发表SCI论文80多篇;曾获全国百篇优秀博士论文、中科院青年科学家奖、上海市青年科技启明星(A类)、教育部自然科学一等奖、国家自然科学二等奖等。

许益祥教授,毕业哈佛医学院基因医学组,现任哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心衰老疾病中心主任,同时担任麻省理工-哈佛大学Broad研究所和哈佛医学院定量基因组学助理教授,哈佛公共卫生学院分子和综合生理科学副教授。

许益祥教授为统计遗传学家/计算生物学家,研究方向有:(1)衰老相关常见疾病的遗传贡献(如骨质疏松症,sarcopenic肥胖、代谢综合征、2型糖尿病和高血压),基于群体的NGS,如全基因组测序,外显子组测序和全基因组关联方法,用于识别与复杂特征相关的常见和罕见变异。(2)使用由ENCODE和美国NIH路线表观基因组学项目产生的组织和细胞特异性基因调控状态来预测GWAS位点的非编码致病变体和靶基因; (3)多表型关联分析的统计方法开发; (4)使用系统遗传学和生物功能方法整合组学数据(基因组学,转录组学,表观基因组学,蛋白质组学和代谢组学)和(5)使用代谢组学鉴定骨质疏松的生物标志物。

2012年毕业于约翰霍普金斯大学医学院生物医学工程系,师从Joel Bader博士,主要研究方向是计算生物学,系统生物学以及人类遗传学。毕业后,黄博士加入麻省总医院Mark Daly博士的研究团队,从事人类基因组学研究。黄博士通过测序和分型分析人类基因组,结合生物网络和系统生物学的手段,找出和疾病相关的遗传信息,并研究疾病发生的机理。黄博士的研究成果发表在Nature, Cell, Genome Research, PLoS Genetics等多家期刊,并拥有美国专利一项。其中关于全基因组关联研究方法的文章(GWAS)被广泛用于寻找与心血管疾病、精神分裂症、自闭症、老年痴呆等遗传疾病有关的基因。

国立台湾大学电子工程博士学位,获得学校杰出研究奖,曾在波士顿学院任高级研究员和博士后,并在卡内基梅隆大学做访问学者,目前就职于Jackson Lab for Genomic Medicine 。李婉萍博士也是千人基因组项目中的一员,拥有生物信息学,电气工程,计算机科学和商业的多学科背景,并开发了若干生物信息学工具,比如短序列比对软件MOSAIK,突变预测软件TANGRAM,以及SIMD Smith-Waterman算法实现。李婉萍目前的研究工作是开发基于图表的参考基因组,以用于代表大量的完整基因组。

生物统计学家,在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和哈佛大学医学院任助理教授。Chibnik博士在国际卫生领域获得公共卫生硕士学位,并在波士顿大学研究疾病风险预测模型方法,获得生物统计学博士学位。Chibnik博士在其职业生涯中,已经开发并评估了多个疾病的预测模型,如HIV,产前筛查和自身免疫性疾病的预测模型,并将其应用于各种疾病。

Chibnik博士目前的研究兴趣是阿尔茨海默病和老年痴呆的遗传学和基因组学,侧重于纵向队列。除研究工作外,Chibnik博士设计的培训班和创新的教学技巧也在国际上具有知名度,已经为不同的国家和机构开发了多个生物统计学课程,其最近一个培训班系列是为非洲地区科学家的而开发的。目前,Chibnik博士在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和Stanley Center for Psychiatric Research at Broad Institute 主持全球神经精神疾病遗传学培训计划。

周一鸣,2005年博士毕业于清华大学生物系,2018年至今任北京新抗元生物技术有限公司CEO。 2014年至2017年任博奥生物集团有限公司首席信息官,兼转化生物信息研究院院长。之前长期在美国纽约大学医学院,阿肯色医科大学,哈佛大学医学院从事生物医学大数据和基因组学的研究,涉及基因调控网络、多发性骨髓癌的基因组分析、中风相关的心脑血管组学、糖尿病人胰岛素抗性原理和生殖健康组学等多个方向。已发表SCI论文 40 篇,被他人SCI引用 > 1000 次。多篇文章文章发表在Nature,Blood,PNAS,Nature Cell Biology,Nature Biotechnolgy等国际一流杂志。其中作为数据分析专家,参与美国药监局领导的MAQC 项目 II 和 III期。文章发表在 2010年和2014年的 Nature Biotechnology。基于以上成果,受邀参与编译中英文学术著作 2 部。获得授权专利 5 项。其中美国专利 3 项,世界专利 2 项。作为主要生物信息学家,参与了申请 2 项美国国立卫生研究院资助项目,以及多项其它研究项目。作为首席科学家,主持完成国家高技术研究发展计划((863 计划)课题“基于区域医疗与健康大数据处理分析与应用研究”(课题编号:2015AA020110)。该课题是国家级第一批生物医学大数据方向的重点资助课题。

 

Chia-Yen Chen

Postdoctoral Research Fellow of Smoller lab,Psychiatric and Neurodevelopmental Genetics Unit,Neale lab,Analytic and Translational Genetics Unit,Massachusetts General Hospital and Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of MIT and Harvard from 11/2013. The Supervisors were Jordan W.Smoller and Benjamin M.Neale.Recent research focuses on novel statistical genetics methods for Mendelian randomization, Using electronic health records and biobanks for psychiatric research, Genome-wide association studies of Posttraumatic Stress Disorder (PTSD) and stress-related disorders, Understanding genetic architectureof complex traits and shared genetic components across traits, Genome-wide studies for psychiatric disorders in Asian Population.

 

 

 

 

 

 

2017年统计基因组学培训会合影

 

 

 

 

 

 

 

  

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