仅需10万个细胞!安诺基因强势推出低起始量Hi-C建库

来源: 安诺基因   2019-1-10   访问量:2495评论(0)

长期以来,“高昂”的Hi-C建库起始量限制了众多科研小伙伴对未知领域的探索,通常近千万个级别的细胞才能满足一个Hi-C文库的构建,极大限制了诸如生殖、肿瘤等研究领域中微量样本的染色质构象解析。降低Hi-C建库起始量,一直是三维基因组学研究者攻关的难题。

 

今天,小编已经按捺不住激动的心情,终于要公布我们的阶段性成果啦~ Duang!我们已成功将细胞类型样本的Hi-C建库起始量由原来的500万个细胞降低至10万个细胞,率先实现了低起始量Hi-C建库的产业化服务,在解决微量细胞建库的道路上我们马不停蹄~ 快来看看我们这波操作6不6吧~

 

样本要求

样本类型:细胞(人、鼠或其他物种)

建库起始量:10万个交联细胞样本/文库(约3ugDNA)

测序平台:Illumina HiSeq X Ten,PE150

 

实测小数据结果

我们对10余例人和小鼠的细胞样本进行了多轮测试,评估结果显示,最终可用于分析的Valid Rate(%)均在60%以上,最高可达83%,有效数据比例杠杠滴~

 

(1)部分人细胞样本结果展示

 

(2)部分小鼠细胞样本结果展示

 

实测大数据结果

我们随机测试了2个人细胞样本的大数据,对大数据上机后的有效比对率和有效数据率分别进行统计,均满足分析需求,结果如下:

 

(1)有效比对率统计

 

(2)有效数据率统计


交互热图结果展示

 

对小数据结果进行交互热图分析,如下图所示,展示了genome-wide Hi-C交互热图。

Tips:10万个细胞建库仅仅是我们的起点,安诺研发团队一直致力于解决珍稀样本的建库问题,让我们相约下一个突破性进展吧~


关于我们

安诺基因作为业内三维基因组测序技术的服务供应商,自2015年初,首次在国内推出动物群体Hi-C和单细胞Hi-C测序服务,随后将人类染色体三维构象解析的分辨率提升至1kb水平,同年12月在国内首次推出植物Hi-C测序服务。四年来,安诺Hi-C技术不断发展,众多研究者利用安诺Hi-C技术取得了丰硕的成果。作为国内三维基因组测序技术的服务提供商,安诺基因与法国居里研究所、中国农业大学、中科院动物所、西南大学、南京医科大学等多家科研院所深度合作,相关研究成果已发表在NatureMolecular PlantNature communicationsGenome Biology等国际高水平期刊,累计IF 97.19,平均IF 12.15


点击下方链接获取更多信息

年终盘点,你不可不知的Hi-C大事件

不用写代码,三步搞定Hi-C多组学分析

Hi-C升级一小步,产品优化一大步

惊!Nature子刊发现病毒侵染竟能改变宿主染色体三维结构!

重磅!安诺Hi-C助力北京烤鸭登顶Nature子刊

又一篇!!!安诺植物Hi-C文章再见刊

Hi-C信息分析,你的数据量够了吗?

开学逆袭攻略—Hi-C研究红宝书

 
文章来源:安诺基因



安诺基因   商家主页

地址:北京市亦庄经济技术开发区,科创六街生物医药园B1-B2栋,安诺优达
联系人:裴博士
电话:4008-986-980
传真:010-56315338
Email:service@genome.cn