肿瘤结构变异 5% FFPE标准品-相关检验试剂-试剂-生物在线
肿瘤结构变异 5% FFPE标准品

肿瘤结构变异 5% FFPE标准品

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产品名称: 肿瘤结构变异 5% FFPE标准品

英文名称: Onco Structural Multiplex 5% FFPE DNA

产品编号: GW-OPSM002

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产品产地: 深圳

品牌商标: GeneWell

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使用范围: null

菁良科技(深圳)有限公司
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产品介绍

 

FFPE是活检标本的一种保存和制备方式,有助于实验研究和诊断流程/药物开发。首先通过将组织样品固定在甲醛(也称为福尔马林)中来保存,以保护组织内的蛋白质和重要结构。接下来,将其嵌入石蜡块中,这样可以更容易地切割所需尺寸的切片,以便安装在显微镜载玻片上进行相关实验。

 

肿瘤结构变异 5% FFPE 标准品是一种高度特征化,生物学相关的FFPE质量控制材料,涵盖多种基因变异,包含SNP和插入,缺失,拷贝数变异,基因融合等突变类型,用于评估从样本提取到定量的全流程各步骤,有助于修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等,并进行后续的一系列应用。

 

详细信息

 

突变类型

突变位点

突变频率

COSMIC编号

CDS突变

染色体编号

染色体位置

SNV High GC

AKT1 E17K

5%

COSM33765

c.49GA

14

104780214

SNV Low GC

PIK3CA E545K

5%

COSM763

c.1633GA

3

179218303

Long Insertion

EGFR_V769_D770insASV

5%

COSM12376

c.2307_2308insGCCAGCGTG

7

55181316-55181317

Long Deletion

EGFR_ΔE746-A750

5%

COSM6223

c.2235_2249del15

7

55174772-55174786

Fusion

CD74-ROS1 translocation

5%

COSF1200

NA

6,5

117700222,149782188

Fusion

EML4-ALK translocation

5%

COSF734

NA

2,2

42472827,29446394

CNV

MET amplification

3.5 copies

NA

NA

7

116672196-116798386

CNV

HER2 amplification

7.0 copies

NA

NA

17

39687914-39730426

 

QC标准

 

检测项目

检测方法

质量标准

等位基因突变频率

伯乐 QX200微滴式数字PCR

AF0,可接受AF≤0.1%  

AF1%,可接受误差范围=±40%; 

1%≤AF≤5%,可接受误差范围=±30% 

5%AF≤20%,可接受误差范围=±20%

 20%AF,可接受误差范围=±10%; 

拷贝数变异<5,可接受误差范围= ±10%  

5≤拷贝数变异<10,可接受误差范围=±30% 

10≤拷贝数变异,可接受误差范围=±20%

基因型

Sanger

检出突变

质量

琼脂糖凝胶电泳

电泳条带清晰明亮

定量

Qubit® dsDNA BR assay (DNA)

≥400 ng/(Maxwell® 16 FFPE plus LEV DNA Purification Kit (Promega))

RNA表达(FFPE RNA

End-Point RT-PCR

目标区域出现清新明亮的条带,而阴性对照组在目标区域不出现条带

 

 

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