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柱式腐殖酸清除剂

柱式腐殖酸清除剂

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产品名称: 柱式腐殖酸清除剂

英文名称: Gel Based TAL Kit

产品编号: 60801

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产品产地: 中国

品牌商标: 雅吉生物

更新时间: null

使用范围: null

上海雅吉生物科技有限公司
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 上栏中为肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)。

 

产品及特点

用绝大多数文献报道的方法从土壤或湖海沉积物中提取的DNA都含有棕黑色或黑色的腐殖酸的污染,而腐殖酸对PCR等后续反应有极大的抑制作用。本产品从柱式DNABACK改进而得,专门用于从土壤DNA样品中清除腐殖酸污染。

1. 去污染效果好,能使腐殖酸的浓度降低10倍以上。

2. DNA回收率高,一般都在80%以上。

3. 操作过程简单快速,只需要10分钟。

4. 扩容性好,可小规模操作,也可以大规模操作。

5. 处理后的样品原液或稍微稀释后即可用于PCR。

使用及效果

将专用上柱液与含腐殖酸的DNA样品按1:3的比例混合后上柱,用0.5 mL专用洗柱液洗离心柱两次,最后用专用洗脱液将DNA洗脱即可用于PCR。

 

图注:从泥碳(腐殖酸含量大于60%)中提取的DNA用本产品处理前

(B)和处理后(A)的颜色对比。处理前OD340为4.0(4为所用分光光度计的上限,实际读数可能远高于4), 处理后降低到0.3。处理前的原液、10倍和100倍稀释液均无PCR扩增, 而处理后均可以扩增。

 

腐殖酸及其特点

腐殖酸(humic  acid)是动、植物的残骸经过微生物的分解转化和成千上万年的复杂化学反应而产生的,广泛存在于土壤表面和江海沉积物中的一大类呈棕黑色或黑色的物质,其典型的分子结构如下:

腐殖酸的特点一是结构千差万别,二是能与金属离子复合,三是能跟很多有机分子相互作用。由于这些特点,一般DNA提取方法很难将各种腐殖酸分子与土壤DNA分离。污染的腐植酸可以抑制PCR反应和限制性内切酶酶切反应,还可以降低DNA的杂交效率和质粒的转化效率。由于腐殖酸是一大类物质,其组成和特点随土壤不同而不同,所以其最大吸收波长也各不相同,有的土壤的腐殖酸在260 nm有最大吸收(见Appl.Environ. Microbiol.,63:4993,1997),有的则在340  nm。所以用特定的波长测定OD值不是定量腐殖酸的最佳方法,波长的选定要根据土壤的不同而决定。Sigma,Fluka等公司出售的腐植酸产品成分一般比较简单,其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品