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DNA Shuffling试剂盒

DNA Shuffling试剂盒

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产品名称: DNA Shuffling试剂盒

英文名称: DNA Shuffling Kit

产品编号: HZ131178

产品价格: 0

产品产地: 中国/上海

品牌商标: 沪震生物

更新时间: 2023-08-17T10:24:20

使用范围: null

上海沪震实业有限公司
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 DNA Shuffling试剂盒

中文名称:DNA Shuffling试剂盒
英文名称:DNA Shuffling Kit
产品规格:10次
DNA Shuffling即DNA分子的体外同源重组,它是一种分子水平上的定向进化(directed evolution)技术,它以一个或多个基因为起始材料,通过先随机断裂成小片段,再进行互为模板和引物的PCR(无外加引物),最后再进行常规PCR(外加引物)等处理,最后得到含有大量DNA重组突变的PCR产物。其原理示意图如下:
DNA Shuffling试剂盒原理示意图

产品特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品DNA模板,无需单独准备各成分。
2.操作手册经过优化,1-2天即可完成,节省大量优化时间。
3.本产品只适用于科研,不能用于临床诊断。

试剂盒组成:

成分 规格
PCR Mix 3.0,2× 1.5mL
DNase I溶液(1U/μL) 10μl
溶液A,10× 60μl
溶液B,10× 60μl
超纯水 1mL
说明书 1份



储存条件:低温运输,-20℃保存,保存期限一年。

使用方法:
1.待突变基因片段的制备:待突变基因片段可以用含此基因的质粒为模板、用PCR法或酶切法制备。制备时需保证含此基因(或此基因的一部分)的DN**段总长度不要超过1kb,同时比DNA shuffling终产物(第二轮PCR产物)长200-400bp。每次DNA Shuffling实验至少需要2μg起始DN**段(如果含几个基因片段,则彼此的比例为1:1),并且必须通过胶回收的方法回收,以便彻底去除残留的质粒模板、引物和非特异扩增产物等。最后需用分光光度法准确定量。
2.提前准备37℃和75℃水浴,同时新鲜配制0.1U/μL的DNase工作液放冰上待用(必须在用时才配制,方法是将1μl 本试剂盒提供的1U/μL的DNase I溶液和1μl溶液A和8μl超纯水混合)。此溶液需在24小时内使用。
3.在一个离心管中,按顺序加入下列成分:

成分 用量
待突变基因片段(第1步制备) 2μg
溶液A 5μl
溶液B 5μL
DNase I工作液(第2步制备) 2μL
超纯水 36μL


4.充分轻柔吹打混匀后37℃水浴8分钟,然后立即放75℃水浴处理10分钟以灭活DNase I。
5.在2-3%琼脂糖凝胶上电泳,用常规的胶回收法回收25-150bp范围的所有片段待用。注意:一定要加合适的DNA marker以便确定片段范围,最好使用本公司生产的绿如蓝核酸染料(可见光型)作为电泳染料以避免用UV照射DNA,否则UV使DNA发生的交联将极大降低后续扩增效果。
6.分光光度法精确测定回收片段的浓度。
7.在PCR管中按顺序加入0.5μg上步回收得到的回收片段、50μl 2×PCR Mix、加超纯水到100μl。
8.按下面的PCR反应参数进行第一轮无引物PCR:

过程 温度 时间
PCR前变性 94℃ 150s
PCR反应(40循环) 94℃ 30s
47.5℃ 45s
72℃ 10s,每次循环后增加5s
PCR后延伸 72℃ 10min
 


9.取5-10μl进行电泳检测,然后进行PCR回收,得到第一轮PCR产物。
10.将回收的第一轮PCR产物1μl原液作为模板设置3管第二轮PCR反应。

成分 用量
回收的第一轮PCR产物 1μL
PCR Mix 3.0,2× 50μL
自备DNA Shuffling引物 各1μM
超纯水 加水到100μL


11.按下列PCR参数进行第二轮PCR。

过程 温度 时间
活化 94℃ 150s
PCR反应(25次循环) 94℃ 30s
47.5℃ 45s
72℃ 60s,每次循环后增加5s
PCR后延伸 72℃ 10min


12.电泳检测,回收预期大小的PCR产物,用于后续的构建克隆文库实验(略)。

疑难解答:
Q:易错PCR和DNA Shuffling有何区别?
A:前者引入的是点突变,后者引入的是重组突变。示意图如下:
者引入的是点突变,后者引入的是重组突变。示意图如下 

特别提示:本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!