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转录组分析,数据深入挖掘

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产品名称: 转录组分析,数据深入挖掘

英文名称: Transcriptome

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西农生(北京)生物技术有限公司
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  转录组测序及分析,数据深入挖掘
 
Illumina 2500 高通量测序平台,通过信息分析,可获得基因表达差异信息、SNP分析、预测新转录本等信息,为研究基因的结构和基因的表达调控提供了重要的手段。   
 
 
 
分析流程及内容:
 

 
标准信息分析
l  对原始数据进行去除接头和低质量reads的处理
l  测序评估
l  基因表达注释
l  基因差异表达分析
l  预测新转录本
l  等位基因差异表达分析(需正反交实验设计)
 
无参考序列信息分析
l  对原始数据进行去除接头序列及低质量reads的处理;
l  数据产出统计及测序数据的成分和质量评估;
l  组装结果分析(Contig长度分布、Unigene*长度分布);
l  Unigene  功能注释及COG分类;
l  Unigene  的GO分类;
l  Unigene  代谢通路分析;
l  预测编码蛋白框(CDS);
l  Unigene  表达差异分析;
l  Unigene  在样品间的差异GO分类和Pathway 富集性分析;
l  SNP  分析;
l  SSR  开发及引物设计;
l  主成分分析(五个或五个以上样品);
l  条件特异表达分析(五个或五个以上样品)
 
 

 
 
 可根据需求进行个性化分析,提供分析代码,客户可重现分析。
 
 
另:提供单细胞测序、LncRNA测序等。