肠道菌群多样性分析 intestinal microbial diversity

产品内容：

整套肠道菌群多样性分析：“实验规划->样本采集->肠道微生物序列测定->生信统计学分析->论文协助”。

样品采集：

可为客户提供样品采集盒和样本保存液。

检测平台：

Illumina、Ion PGM、PacBio等高通量测序分析、PCR-DGGE、实时荧光定量PCR、克隆文库等多种微生物多样性分析平台。

送样要求：

 样本类型

(1)样品类型：粪便，新鲜取样，冻存于-80℃

(2)样品需求：≥2g

(3)样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输

(4)对于本种类型的样品，我们将采用Qiagen QlAamp DNA tool Mini Kit进行基因组DNA抽提

DNA类型

(1) 样品类型： DNA

(2) 样品需求量：≥300ng

(3) 样品浓度： ≥10ng/μL

(4) 样品纯度：OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解

(5) 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输

(6) 对于本种类型的样品，我们在检测完样品的质量后，进行PCR扩增等后续试验。

联系方式

技术咨询热线 /企业QQ：400-660-9270    

电话询价：021-31606760/021-31606761

或请登陆公司官方网站查阅： www.tinygene.com   

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期待您的来电！专业、专注，用心服务！

肠道微生态高通量分析流程

• 样品采集及运送：

　　新鲜样品：≥ 2 g（约一节小拇指大小）。采集时应避免厕所污水及马桶上微生物的污染。可先收集于无菌的医用粪便收集器皿中，再转移到专用的无菌粪便采集管中。
DNA样品：样品需求量：≥ 300 ng；样品浓度：≥ 10 ng/μL；样品纯度：OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解；
样品运送：干冰或冰袋保存寄运。

• 生信/统计分析

案例分析：

标题：巴布亚新几内亚人肠道微生物：组成，多样性及生态形成过程 （Cell Reports, IF: 8.358）

研究领域：肠道微生物

分析物种：细菌

高通量测序平台：Illumina MiSeq

测序区域：16S rRNA gene V5-V6 region

主要结果：

　　（1）PNG和US人群肠道微生物多样性分析

（2）细菌多样性图谱

　　（3）

　　（4）

原文链接：http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211-1247(15)00340-Xv

参考文献：

Martinez, I., J. C. Stegen, M. X. Maldonado-Gomez, A. M. Eren, P. M. Siba, A. R. Greenhill and J. Walter (2015). “The gut microbiota of rural papua new guineans: composition, diversity patterns, and ecological processes.” Cell Rep 11(4): 527-538.