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全基因组甲基化测序

全基因组甲基化测序

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产品名称: 全基因组甲基化测序

英文名称: WGBS

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产品简介

全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是 DNA 甲基化研究的金标准,它通过 Bisulfite 处理和全基因组 DNA 测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基分辨率,可精确评估单个 C 碱基的甲基化水平,构建全基因组精细甲基化图谱。

 

应用领域

医学研究方面:复杂疾病的发生、发展机制;干细胞的传代、分化、重编程过程中甲基化调控;以及环境因素(如激素、饮食、压力、损伤等)对甲基化修饰的影响;

农业研究方面:绘制某物种的甲基化图谱,研究特定区域的甲基化与物种特定表型的相关性,进一步研究营养、环境、自然选择压力对物种的甲基化修饰的影响,为动植物分子育种研究提供基础。

 

技术流程

       样本质控  甲基化文库构建  上机测序  数据处理  数据分析

 

生物信息分析流程图

 

备注:可进行定制化分析

 

案例分享

案例一

全基因组重亚硫酸盐测序应用于小鼠造血干细胞中DNA甲基化[1]

利用全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术对2个激酶抑制剂(2i)处理后的小鼠造血干细胞(ESCs)和正常小鼠造血干细胞(ESCs)进行甲基化模式分析,结果显示雄性2i ESCs与ESCs相比较呈现低甲基化状态,2i抑制了ESCs的甲基化和内细胞团状态。为探索DNA甲基化在人工培养ESCs早期发育过程中的作用提供了分子基础。

 

案例二

表观遗传调控为母亲产前压力与儿童哮喘的关系提出新颖见解[2]

孕妇产前心理压力大会增加孩子哮喘风险的分子机制未知,本试验利用全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术分析母亲与孩子DNA甲基化的差异来探究环境与甲基化修饰的关系。结果表明孕妇产前压力较大时,母亲与孩子的增强子都呈现高甲基化状态,孩子神经分泌物与神经递质受体之间相互作用被解除,患有顽固性哮喘的风险比较高。


参考文献

[1] Ehsan Habibi, et al. Whole-Genome Bisulfite Sequencing of Two Distinct Interconvertible DNA Methylomes of Mouse Embryonic Stem Cells. Cell Stem Cell,2013,5:13,360-369.
[2] Saskia Trump1,et al. Prenatal maternal stress and wheeze in children: novel insights into epigenetic regulation. Scientific Reports. 2016, 6:28616.

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