甲基化芯片850K北京华诺时代科技有限公司

技术服务信息

服务名称:甲基化芯片850K
服务类别:分子生物学服务 - 细菌菌株构建服务
价格:询价
允许参观:协商决定
所在区域:北京.北京
更新时间:2016-9-5 9:41:00
浏览人数:81
诚信指数:7点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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北京华诺时代科技有限公司
地址:
北京市中关村科技园昌平园17号楼
邮编:
102200
电话:
010-56216623
传真:
联系人:
黄喜斌
所在区域:
北京·北京
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技术服务详细描述

 

产品简介

采用Illumina850公司的850K甲基化芯片对DNA甲基化情况进行检测。Illumina850K甲基化芯片设计了850,000多个甲基化位点,全面覆盖了95%的CpG岛,99%的RefSeq Genes,保留450K芯片90%的位点外,还在增强子区域新增了350,000个甲基化位点(ENCODE enhancers,ENCODE open chromatin, >80% of FANTOM5 Enhancers,GENCODE genes, promoters, UTRs),所需要的DNA起始量低至250ng,兼容FFPE, 支持LIMS及自动化系统,包含三种规格试剂盒:16,32,96样本。

应用领域

胚胎发育和组织分化,复杂疾病的发生、发展机制,环境因素(如***、饮食、压力、损伤等)对与甲基化修饰的关系。

技术流程

       样本质控  亚硫酸盐处理  全基因组扩增及片段化  芯片杂交、洗脱、延伸、成像扫描  数据分析

产品参数

产品 策略 信息分析 项目周期
甲基化芯片 Illumina Human Methylation 850K BeadChip 标准分析 25个工作日

生物信息分析流程图

 

备注:可进行定制化分析

案例分享

案例一

Infinium HumanMethylation 450 BeadChip芯片分析结直肠癌全基因组甲基化模式[1]

使用Infinium HumanMethylation450 BeadChip 在22对结肠直肠癌(CRC)、癌旁组织和19个健康人的直肠组织样本中进行全基因组的DNA甲基化分析,鉴定到15667个与结肠直肠癌相关的甲基化位点。通过分析确定了SND1, ADHFE1, OPLAH, TLX2, C1orf70, ZFP64, NR5A2和 COL4A几个可靠的甲基化标记,且在大样本得到验证,有望作为结直肠癌的诊断标志物。


参考文献

[1]Naumov, V. A., E. V. Generozov, N. B. Zaharjevskaya, D. S. Matushkina, A. K. Larin, S. V. Chernyshov, M. V. Alekseev, Y. A. Shelygin and V. M. Govorun. "Genome-Scale Analysis of DNA Methylation in Colorectal Cancer Using Infinium Humanmethylation450 Beadchips." Epigenetics 8, no. 9 (2013): 921-34.

北京华诺时代科技有限公司

地址:北京市中关村科技园区昌平园17号楼

服务热线:400-890-6119

网址:www.honortech.cn

 

 

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