sdRNA测序服务上海康成生物工程有限公司

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技术服务信息

服务名称:sdRNA测序服务
服务类别:分子生物学服务 - 第二代高通量测序
价格:无元
允许参观:允许参与实验
所在区域:上海.上海
更新时间:2016-9-13 13:48:00
浏览人数:139
诚信指数:860点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海康成生物工程有限公司
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传真:
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上海·上海
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技术服务详细描述

       sdRNAs是来源于snoRNAs的单链非编码RNA,长度在15-30nt之间。根据它们来源的snoRNAs的不同,sdRNAs多数具有保守的C/D box 或者H/ACA box序列。一些sdRNAs具有类似miRNA的活性,能够调节mRNA的翻译和稳定性。越来越多的证据表明在肿瘤组织中,sdRNAs呈现异常表达。并且sdRNAs能够在血液、尿液等中稳定存在且可检测到,使其可能成为潜在的肿瘤标志物。
 
康成生物sdRNA测序服务优势
1. 技术优势
       高精度单碱基序列解析;覆盖sdRNAs全长序列;区分sdRNAsnoRNA;无交叉杂交歧义问题;检测低丰度sdRNA;解析细小差异表达sdRNA;技术重复性;从样品到数据高性价比的全套优质服务。
2. 覆盖面和注释
       适于任何物种;无需参照sdRNA;发现新的sdRNA。
3. 功能齐全的软件分析包
   根据接头序列调整长度;发现新的sdRNA和二级结构的预测。
 
康成生物基本数据分析结果展示
1. 测序结果整合
   对测序结果进行整理分析得出sdRNA的基本信息:名字、基因定位、序列、reads数、长度、变化倍数、p-valuesdRNAsnoRNA上位置信息等。
    
                    图1. sdRNA测序结果整合基本信息列表
 
2. 差异表达sdRNA分析
   
               2. 差异表达sdRNA统计列表
 
3. 大小分布分析
  
               3. sdRNA大小分布分析
 
4.sdRNAssnoRNAs整体定位分析
  
 图4.sdRNAsnoRNA上的整体定位分析:黑色:sdRNA;红色:C-box/H-box;蓝色:D-box/ACA-box
 
5.基因组织形式、二级折叠、片段化模式分析
     
              5.基因组织形式、二级折叠、片段化模式分析
 
6.聚类分析和热图
  
                   6.sdRNA的聚类分析以及热图
 
7.生物重要性分析
  
                    7.差异表达的sdRNAs火山图分析
 
8.PLS-DA或者PCA分析
   
                        8.PLS-DA分析

 

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