MBS(mapping-by-sequencing)上海欧易生物医学科技有限公司

技术服务信息

服务名称:MBS(mapping-by-sequencing)
服务类别:分子生物学服务 - 第二代高通量测序
价格:询价
允许参观:允许参观
所在区域:上海.上海
更新时间:2016-9-26 10:33:00
浏览人数:69
诚信指数:282点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海欧易生物医学科技有限公司
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传真:
021-34781616-8056
联系人:
刘进
所在区域:
上海·上海
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技术服务详细描述

 MBS (mapping-by-sequencing)

针对有参考基因组的物种,利用混合分组分析(BSA , bulk segr egant analysis)结合全基因组重测序,将鉴别到的分子标记与性状进行共分离分析,对锁定到的目标区间内的基因进行功能注释,实现性状决定基因的快速定位。

欧易特色

● 与传统的图位克隆相比,耗时短、成本低、定位更准确

● 根据每个客户的研究目标和内容灵活定制研究方案

● 提供标准和高级生物信息分析,可根据客户需求提供个性化数据分析

● 欧易生物已成功完成拟南芥、水稻等多个物种突变体定位项目

项目流程

提取基因组DNA---测序文库构建(~350bp)---上机测序---原始测序数据---数据质控--标记分型---数据分析

推荐测序模式

● Hiseq4000, PE150 ● ≥30 X基因组大小

样品要求

● DNA:≥1 μg ● OD260/280为1.8-2.0

● 适用范围:

· 单倍体、二倍体或多倍体物种(有参考基因组) ·家系群体(F2、DH、RIL等皆可)

· 子代混池规模:质量性状≥50个个体;数量性状≥30个体且不超过总群体10%比例

数据分析内容

标准数据分析

● 数据质控

● 产出统计

● 比对参考基因组

● SNP位点的鉴定与分型

高级数据分析

● 统计全基因组SNP等位位点频率

● 绘制SNP等位位点频率累积曲线

● Causal mutation位点的鉴别

● Causal mutation位点的注释

了解更多基因组研究,请登录www.oebiotech.com

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