北京安必奇生物科技有限公司
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代谢组学与转录组学和蛋白组学比较具有以下优点：
- 易于检测：代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化，从而使检测更容易。
- 有数据库：代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列标签（EST）或者全基因组的数据库，目前有相当多的化合物库可以使用。
- 通用性强：由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的，所以研究中采用的技术更为通用，也更易被人们所接受。
- 结果直接：代谢物可反映生物系统的生理和病理状态，可以区分同种不同个体之间的表型差异等。
- 数据准确：使用高分辨质谱得到的数据准确，可重复性好。
代谢组学分析通常有两种主要方法：
非靶向代谢组学
- 代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物；
- 鉴定，进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构；
- 解释，研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。
靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本, 验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。