Hi-C三维基因组武汉金开瑞生物工程有限公司

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技术服务信息

服务名称:Hi-C三维基因组
服务类别:分子生物学服务 - 基因组分析服务
价格:请询价
允许参观:允许参观
所在区域:湖北.武汉
更新时间:2018/9/29 16:29:00
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诚信指数:406点
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武汉金开瑞生物工程有限公司
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湖北·武汉
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技术服务详细描述

 
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。
(引自Pueschel R, Coraggio F, et al. From single genes to entire genomes: the search for a function of nuclear organization. Development , 2016 , 143 (6) :910
武汉金开瑞生物工程有限公司技术顾问、华中农业大学教授, 曹罡课题组与华中农业大学李国亮教授课题组在国际著名期刊Nature GeneticIF=27.125)上联合发表题为“Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture”的研究论文。该论文主要介绍了一种新的染色体构象捕获技术(DLO Hi-C此技术信噪比高,质量控制于早期为解析基因组三维结构提供了一种新型、高效、经济的研究方法。
DLO Hi-C实验流程
 EGS和甲醛双交联——同时消化和连接——近端连接和酶切——固定80bp短片段建库测序——分析
 
特点:双交联,两次连接消化,收集测序固定片段;无稀释液体交联,无生物素。
研究思路
Hi-C可以与RNA-SeqChIP-SeqATAC-Seq等数据进行联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。
结果展示
1、几种不同的Hi-C衍生方法的对比分析
2、几种不同的Hi-C的衍生方法的矩阵图
3、较优的三种Hi-C衍生技术的A/B compartments TADsLoops 的数据读取。
    
 
 
 
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Promoter interactome of human embryonic stem cell-derived cardiomyocytes connects  GWAS regions  to cardiac gene networks
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Nature        Communications
12.353
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 关于金开瑞:
  武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地,是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。
关注蛋白整体研究思路,围绕蛋白的读、解、写、用,金开瑞建立起蛋白组、检测分析、基因服务、病毒包装、蛋白表达、抗体制备六大核心技术平台。所有平台的实验室及技术团队都坚持自主建设,各平台技术负责人都有5年以上相关领域的工作经验,可以最大程度的保障了项目按时保质的实施。完整的技术平台及专业的技术团队,保证了金开瑞不仅可以提供单一项目的技术服务,还可以提供miRNA,lncRNA,蛋白质组学相关等多种整合性项目服务。
更多服务内容及优惠活动,详见公司主页:http://www.genecreate.cn/
咨询电话:027-62431110
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