技术简介
dRNA测序是原核生物转录组解析利器，云序独家提供dRNA测序服务，采用5’单磷酸依赖的外切酶，可以特异性地降解加工过的转录本，从而使初始转录本得到富集，从而可以区分初始转录本和加工后转录本，dRNA测序 已被广泛应用到原核生物转录起始位点分析、sRNA鉴定、启动子及操纵子等研究中。

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云序优势
sRNA检测利器：
准确识别﹑检测新sRNA，并对其序列进行全长鉴定。
精确区分原始转录本和成熟转录本:
可精确区分初始转录本和加工后转录本。
全面的TSS分析：
提供全面﹑精确的转录起始位点分析。
可靠的启动子/操纵子注释和分析：
提供可靠，准确的启动子和操纵子鉴定﹑注释和分析。
全面覆盖：
可对几乎所有的原核生物进行转录本分析。
样品要求
样品类型：
细菌或RNA样品。其它类型样品请详询。
样品量：
a）细菌：5×10⁷
b）总RNA大于2 μg（OD260/280：1.6-2.3；浓度≥500ng/μl；RNA无明显降解28S：18S≥1.5或者RIN≥7）
样品运输及保存：
样品运输：样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输。
样品保存：细菌样品可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
数据分析
1、dRNA可视化图

2、TSS分类

3、操纵子转录模式

4、启动子motif分析

案例解析
案例一：dRNA测序在全基因组水平上鉴定初始转录本
原文：The primary transcriptome of Neisseria meningitidis and its interaction with the RNA chaperone Hfq

期刊：Nucleic Acids Research 影响因子：11.56
本研究通过对脑膜炎双球菌8013(N. meningitidis strain 8013.)的初始转录本进行dRNA测序。在全基因组水平上绘制了1625个TSS，大多数可编码蛋白，同时也发现少量σ70型启动子，这表明这一激活因子的存在弥补了-35共有序列缺失的影响。转录组水平也发现65个候选sRNAs，其中1/3已验证。