- 联系人 :
- 地址 : 上海市斜土路1175号景泰大厦1508
- 邮编 : 200032
- 所在区域 : 上海
- 电话 : 138****7942
- 传真 : 021-54035803
- 邮箱 : shdobio@163.com
基因芯片技术服务
主要功能
1. 基因芯片技术服务能够完成小鼠和人类基因表达谱芯片的优化和批量制作。
2. 通过对基因芯片数据处理和分析，可对芯片数据进行倍值，统计，聚类，分子网络等系列分析。
3. 通过设计TaqMan探针和引物可提供对芯片结果的定量实时PCR(TaqMan)验证支持。
4. 提供对小鼠和人类表达谱芯片所有基因的生物信息学自动注释及更新。
实验仪器
1. OmniGrid100 Microarrayer
主要特点与技术参数
· 高速可靠的马达和和移动平台精确性:两次重复<+-2.5um
· 步进精度：2.5um(X轴和Y轴):1.25um(Z轴)
· 配的是Telechem针,点的平均大小约150um
· 一次最多可放置100块标准玻片，每片现在最多可点22000个点
2. Genepix4000B Scanner(Axon)
主要特点与技术参数
· 是基于PMT(photomultiplier tube, 光电倍增管)的检测系统的激光共聚焦原理。
· 可以选择同步或是连续扫描，同步扫描可以避免由于机械原因造成的玻片的定位不准确，扫描误差的出现。
· 为单玻片手动载入，具有635nm(红色的)和532nm(绿色的)两色激光以及适配的红色和绿色的发射滤光片。
· 它可扫描多种材料，扫描大小为25mm×75mm。
· 激光强度由5-100%连续可调。
· 扫描精度可从5μm-10μm分级调整
人和小鼠的cDNA表达谱芯片基本分类信息
| 人的cDNA表达谱芯片基本分类信息 | 小鼠的cDNA表达谱芯片基本分类信息 | ||
| Biological Process | gene number | Biological Process | gene number |
| Amino acid metabolism | 44 | Cell juction protein | 23 |
| Apoptosis | 237 | Chaperone | 17 |
| Carbohydrate metabolism | 132 | Cytoskeletal protein | 37 |
| Cell adhesion | 274 | Extracellular matrix | 20 |
| Cell cycle | 425 | Hydrolase | 460 |
| Cell proliferation and differentiation | 283 | Ion channel | 62 |
| Cell structure and motility | 79 | Isomerase | 52 |
| Coenzyme and prosthetic group metabolism | 3 | Kinase | 421 |
| Developmental processes | 750 | Lyase | 68 |
| Electron transport | 200 | Nucleic acid binding | 444 |
| Homeostasis | 44 | Oxidoreductase | 334 |
| Intracellular protein traffic | 62 | Phosphatase | 32 |
| Lipid, fatty acid and steroid metabolism | 183 | Protease | 8 |
| Muscle contraction | 68 | Receptor | 447 |
| Neuronal activities | 62 | Signaling molecule | 156 |
| Nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism | 246 | Synthase and synthetase | 51 |
| Phosphate metabolism | 25 | Transcription factor | 307 |
| Protein metabolism and modification | 227 | Transferase | 496 |
| Protein targeting and localization | 18 | Transporter | 231 |
| Signal transduction | 1065 | ||
| Transport | 1019 | ||
服务内容
| 服务名称 | 服务内容 |
| 定制芯片 | 根据顾客需要设计和制备cDNA芯片 |
| 芯片实验设计 | 为顾客设计优化芯片实验以利于得到可靠的数据和成果发表 |
| RNA样品制备 | 从细胞或组织中提取RNA样品 |
| 样本标记和杂交 | 1. RNA→cDNA→cRNA,单荧光标记，与Codelink或Affymetrix oligo芯片杂交 2. RNA→cDNA，Cy3与Cy5标记，与cDNA芯片杂交 |
| 芯片简单数据处理 | 1. 芯片所含基因的GeneBank号、基因名称与功能简单描述 2. 芯片实验检测得到的信号值 3. 数据分析后的信号比值，排序，筛选表达显著性改变的基因 4. 芯片荧光信号彩色图谱一张 |
| 芯片数据系列分析 | 统计分析，聚类分析(Hierarchical Clustering)，组图分析(Self_Organizing Maps, SOMs)，分子网络(pathway analysis) |
芯片技术服务内容说明
1. 费用：对于材料费(芯片费用)我们将给予优惠的价格；由于我们与Codelink和Affymetrix公司有着很好的战略伙伴关系，我们愿意全力协助广大的科研人员并以最优惠的价格提供服务。详细服务价格敬请来电查询。(也可以自行提供.)
2. RNA样本要求：a) cDNA芯片，每张芯片需提供30µg-60µg total RNA。b) Codelink或Affymetrix的寡核苷酸芯片，每张芯片需提供5ug-15µg total RNA。
3. 时间：服务所需时间依样本情况而定，一般情况下，当我们收到您所提供的达到要求的样本后2周后即可交付结果。
服务价格
| 服务内容 | 服务收费 | |
| 芯片制作 | ||
| 开机费 | 2500元（6小时内），每小时加收250元 | |
| 玻璃片 | 150元/张 | |
| 384-well plate | 250元/plate | |
| 点样 | 4元/点 | |
| 样品固定 | 180元/次 | |
| 转移样品 | 600元/384-well | |
| 芯片点样位置设计 | 1000点 350元/次 | |
| 1001-5000点，550元/次 | ||
| 5000点，850元/次 | ||
| 核酸提取及荧光标记 | 视具体实验内容收费 | |
| 杂交反应 | 视具体实验内容收费 | |
| Axon Scanner图象扫描 | 600元/张芯片 | |
| Genepix定量分析 | 1000点，550元/张芯片 | |
| 1001-5000点，850元/张芯片 | ||
| 5000点，1200元/张芯片 | ||
| 基因表达的Real-time RT-PCR验证 | ||
| 引物设计、RNA逆转录、Real-time RT-PCR及数据分析 | 视具体实验内容收费 | |
| 基因芯片数据分析 | 数据质量评估 | ￥180/张 |
| 基本数据分析（杂交信号值、基因注释、信号比值、差异表达基因的筛选） | 前两张：￥3500/张， 多于两张则以后￥600/张 | |
| 高级数据分析服务（基本数据分析、统计分析、筛选差异表达基因、表达模式识别、功能富集分析、文献挖掘等） | ￥6000/张 | |