基因表达差异分析北京博奥晶典生物技术有限公司

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技术服务信息

服务名称:基因表达差异分析
服务类别:分子生物学服务 - 生物信息学服务
价格:询价
允许参观:不允许参与实验
所在区域:北京.北京
更新时间:2019/12/3 15:31:00
浏览人数:3141
诚信指数:1946点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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北京博奥晶典生物技术有限公司
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技术服务详细描述

基因表达差异分析

  基因表达差异分析常常是表达谱芯片分析首要目的。要达到这一目的,表达谱芯片数据一般先要进行数据预处理,包括各种质控判断和芯片数据的归一化。根据实验设计的不同,基因表达差异分析也有不同类型。

  数据预处理

  针对不同芯片数据选择不同的质控方法和数据标准化方法。常用的芯片质控和数据归一化方式有:

      

     

   
   
 
 

  多组间差异基因分析

  筛选两组或多组样品之间显著性的差异基因。通过T-test或方差分析等各种统计分析得到的p-vluae并结合倍数筛选方法,筛选出不同组间差异显著的基因。根据实验样本分组的不同来选择不同的检验方法进行差异分析。

      

  组织特异性表达基因分析    

  组织特异性基因是指仅在某一分组中相对高表达的基因,寻找组织特异性基因可以通过方差分析或SAM软件分析,结合p-vluae和Fold change筛选出每个分组中特异表达的基因。下图是挑选组织特异性表达基因并以层次聚类图展示结果。

      

  趋势分析

  趋势分析是寻找具有某种表达模式的基因群的分析,一般适用于不同时间点或药物浓度梯度等逻辑序列的实验。采用统计检验得到的q-value<0.05并结合倍数进行筛选,得到随样本顺序变化有明显表达趋势的基因群。

      

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