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小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)

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产品名称: 小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)

英文名称: sRNA sequencing

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北京百迈客生物科技有限公司
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           选择百迈客技术平台,就是选择科研成功之路!

   小RNA是一类长度在20-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA;
   小RNA是生物体内一类重要的调控分子,调控基因的表达,参与生长发育,抵制非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。

百迈客技术优势

     高通量,低成本。

     高准确性:读长覆盖小RNA全序列,产生的定量数据与实时定量PCR结果具有高度的一致性。

     数字化信号:能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,利于区分相同家族以及序列极为相似的不同小分子RNA。

   通用的平台:可进行目标物种的小RNA序列测定,不需要前体序列信息或是二级结构信息。

   丰富的信息学分析:可获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现新miRNA分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析。

 

生物信息学内容

基础分析:
原始数据去杂,聚类得到小RNA的单拷贝序列库,绘制小RNA长度分布图;
与参考基因组比对,绘制小RNA的全基因组分布图;
分级注释:
与Rfam库比对,注释ncRNA(如rRNA、tRNA、snoRNA、snRNA);
与miRBase库比对,注释已知的miRNA;
与RepBase库比对,注释重复序列;
与Exon/Intron比对,鉴定mRNA降解片段;
结构与功能分析:
预测新的miRNA,预测其二级结构图;
miRNA核酸偏好性分析;
miRNA靶基因预测,靶基因功能注释;
样品间miRNA的差异表达分析;