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百迈客完成世界首个猕猴桃全基因组测序

百迈客完成世界首个猕猴桃全基因组测序

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产品名称: 百迈客完成世界首个猕猴桃全基因组测序

英文名称: Draft genome of the kiwifruitActinidia chinensis

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北京百迈客生物科技有限公司
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为国争光!百迈客携手国内外多家院校完成世界首个猕猴桃全基因组测序

 

是猕猴桃(Actinidia chinensis)的故乡,猕猴桃在我国已有1300多年的培育历史。
由于猕猴桃营养丰富,口感宜人,在约100年前,该物种被引入新西兰,进行了大面积
种植和推广,为当地带去无限的商业价值。
 
次对于猕猴桃种质资源的深入研究中,百迈客生物科技与合肥工业大学、四川大学、
康奈尔大学等国内外院校携手面对新西兰同行的激烈竞争和巨大挑战,采用中国红阳品种
猕猴桃,利用高通量测序手段,结合百迈客独创的SLAF-seq技术,突破重重技术难关,
共同完成了世界首个猕猴桃全基因组测序组装工作。该研究成果轻松击败了新西兰同行的
竞争,成功发表在了世界高水平学术杂志《Nature Communications》上。百迈客生物科技
与国内合作单位强强联手,重新夺回了中国在猕猴桃科学研究和产业的主动权,成功捍卫
了我国本土种质资源研究成果,加速了我国对本土重要物种进行基因组研究的进程。
 
究采用红阳品种猕猴桃,使用Illumina Hiseq2000测序方法,140X覆盖度,利用包含
4,301SLAF标记的高密度遗传图谱辅助scaffold序列组装到29个染色体上,最终结果
获得基因组大小为616.1Mb,包含39,040个基因,高杂合率(1.05%),scaffold N50
647K,远超国际同类型物种基因组组装水平。 
Kiwifruit genome assembly statistics

 

Anchoring the Hongyang genome assembly to the diploid kiwifruit reference genetic map

 

 

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了解更多文章细节:Draft genome of the kiwifruit Actinidia chinensis. Huang S, Ding J, Deng D,
et al. Nature Commun (2013). DOI: 10.1038/ncomms3640. 
 
百迈客SLAF-Seq技术文章:SLAF-seq: An Efficient Method of Large-Scale De Novo SNP Discovery
and Genotyping Using High-Throughput Sequencing. Xiaowen Sun, Dongyuan Liu, Xiaofeng Zhang , et al.

 

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