微生物多样性分析北京亿鸣复兴生物科技

银牌供应商 

技术服务信息

服务名称:微生物多样性分析
服务类别:微生物学服务 - 微生物鉴定服务
价格:询价
允许参观:协商决定
所在区域:北京.
更新时间:2016/7/24 16:44:00
浏览人数:1039
诚信指数:63点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
点此求购 我要咨询
生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

供应商联系卡

北京亿鸣复兴生物科技
地址:
北京市海淀区世宁大厦
邮编:
100191
电话:
010-62895234/18611436905
传真:
010-62895234
联系人:
曲经理
所在区域:
北京·
邮件:
公司展台:
扫一扫,关注我们

技术服务详细描述

      环境微生物多样性检 测,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究,通过对核糖体RNA高变区域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)进行 PCR扩增和测序,然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

      克隆文库分析:
      PCR方法扩增特定环境样品中细菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS,使用TA克隆方法构建克隆文库,挑选阳性克隆测定基因序列,并与GenBank中已知序列进行同源性比较,获得特定环境中的微生物群落结构和多样性信息。
     T-RFLP末端限制性酶切片段分析:
      PCR方法扩增特定环境样品中细菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS,采用T-RFLP限制性内切酶对扩增产物进行限制性酶切,利用DNA分析 仪分析末端限制性酶切片段,获得末端限制性酶切片段长度,峰高及面积等信息,PAT数据库分析比对获得特定环境中的微生物群落结构及多样性信息。
     DGGE变性梯度凝胶电泳分析:
     PCR方法扩增特定环境样品中细菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS,通过变性梯度凝胶电泳分析环境样品中微生物菌群落结构;将凝胶电泳条带回收后克隆测序,确定微生物种属关系,获得特定样品中的微生物多样性信息。

      高通量测序MiSeq分析:
     采用第二代高通量测序平台MiSeq,对核糖体RNA高变区域,比如16SrDNA/18SrDNA/ITS等序列,或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种属关系,获得特定样本中的微生物多样性信息。


    
      DGGE变性梯度凝胶电泳

      变性梯度凝胶电泳是 将DNA置于双重变性条件(温度和变性剂)下进行SDS-PAGE电泳的一种分析方法。当一双链DNA片段通过一变性剂浓度呈梯度增加的凝胶时,此片段迁 移至某一点变性剂浓度恰好相当于此段DNA的低熔点区的Tm值,开始解链,而高熔点区仍为双链。这种局部解链的DNA分子迁移率发生改变,从而达到分离的 效果。

      然而,一旦温度(或 变性剂浓度)达到DNA片段最高的解链区域熔解温度时,DNA片段会完全解链,成为单链DNA分子,此时它们又能在胶中继续迁移。因此,如果不同DNA片 段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来。在DNA片段的一端加入一段富含GC的DNA片段(GC夹子:一般30-50个GC碱基 对),能够保证DNA片段最高解链区域在GC夹子处,它的高解链温度可以防止DNA片段在DGGE胶中完全解链。

      Tm的改变依赖于DNA序列,加了GC夹子后,DNA片段中基本上每个碱基处的序列差异都能被区分开。因此,理论上DGGE可以检测DNA分子中的任何一种单碱基的替代、移码以及缺失。


 

 
 

      采用特异性扩增引物扩增特定环境样品中细菌16SrDNA、真菌18SrDNA/ITS或功能基因DNA,通过变性梯度凝胶电泳分析环境样品中微生物菌群落结构;将凝胶电泳条带回收后克隆测序,确定微生物种属关系,获得特定样品中的微生物多样性信息。

      您获得的DGGE数据结果包括:

 

 
      如果您需要进行其他数据分析,请提供相应数据分析相关文献。


      MiSeq高通量测序
      采用第二代高通量测序平台MiSeq,对核糖体RNA高变区域,比如16SrDNA/18SrDNA/ITS等序列,或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种属关系,获得特定样本中的微生物多样性信息。

MiSeq 测序仪具有样品制备迅速、测序时间快(8小时内)、测序总长长的特点,能 在短时间内获得高质量测序结果。同时,Miseq测序仪整合了簇生成、SBS测序和完整的数据分析,而不再需要配置辅助性硬件。每次反应可以产生6G以上 的数据,测序读长可达到2×250bp,使每个样品的测序量达到普通测序的几百倍,而单条序列的测序费用远低于普通测序。基于以上特点,Miseq逐步被 广泛应用于环境微生物多样性研究。


     
      根据客户提供的样本(环境样本、基因组DNA、PCR产物)及需要检测的微生物多样性类型(细菌、古菌、真菌、功能基因),利用Miseq测序平台对目的片段进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学的分析。

检测样品:
样品种类:土壤、海洋、污泥、动物肠道、水样等;
样品形式:环境样品、基因组DNA、PCR产物;
检测种类:细菌、真菌、古菌、功能基因等。
样品要求:
1.样品类型:DNA或PCR产物
2.样品量:≥500ng或≥100ng
3.样品浓度:≥10ng/μL或≥5ng/μL
4.样品纯度:OD260/280=1.8-2.0,无降解5.样品切忌反复冻融,冰袋或干冰运输。

生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

查看微生物多样性分析 产品的用户还对以下产品感兴趣

  菌种鉴定   [供应商:上海基康生物技术有限公司]
  微生物鉴定(菌种鉴定、真菌鉴定)   [供应商:北京三博远志生物技术有限责任公司]
  细菌菌种鉴定   [供应商:北京基诺莱普生物技术有限公司]
  微生物菌种鉴定   [供应商:北京英茂盛业生物科技有限公司]
  肠道/土壤/水微生物16s rRNA测序/微生物多样性分析   [供应商:杭州谷禾信息技术有限公司]
  阪崎氏肠杆菌   [供应商:西安天隆科技有限公司]
  指定基因之间酵母双杂交检测   [供应商:上海玉华生命科技发展公司]
  菌种鉴定   [供应商:青岛科易仪器有限公司]
  细菌群落结构及多样性分析   [供应商:北京基诺莱普生物技术有限公司]
  upt新型生物诊断试剂技术   [供应商:上海科润光电技术有限公司]

ADVERTISEMENT

找不到您所需的产品,发布求购试试?

标题:*
描述:
姓名:*
Email:*
单位:*
电话:*
地址:*
邮编:
资料: 需要 不需要
报价: 需要 不需要