技术服务信息
技术服务详细描述
BD RhapsodyTM 单细胞分析系统平台简介
BD RhapsodyTM 单细胞分析系统
BD RhapsodyTM 单细胞分析系统能够对成千上万个单细胞的数百个表达基因进行数字定
量,提供足够灵活的定制测定法以满足任何实验需要,可缩短实验时间和降低测序成本 。
系统介绍
BD RhapsodyTM 单细胞分析系统包括 BD Rhapsody 卡式芯片、BD Rhapsody 上样台、
BD Rhapsody 扫描仪三大部分。BD Rhapsody 卡式芯片由上万个微孔组成,主要承担样本以
及文库试剂的添加;BD Rhapsody 上样台作用于卡式芯片可以使上万个细胞掉落在卡式芯片
的微孔中,实现单细胞的分选;BD Rhapsody 扫描仪利用明场荧光法对细胞进行计数和活性
检测,可监测卡式芯片对单细胞的捕获效率以及多重细胞率。
系统原理
BD Rhapsody TM 单 细 胞 分 析 系 统 是 利 用 微 孔 捕 获 的 原 理, 将 成 千 上 万 个 细 胞 分 开, 接
下来在微孔中加入带有条形码的磁珠(beads),实现对单个细胞的标记。后续通过文库构
建及测序,可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,从而实现在单细胞水平进行表达测序
的目的(图 1)。
系统特点
1、强大的 scanner 系统
随时扫描发现细胞捕获效率及多重细胞干扰率 , 可及时监测捕获结果,
提高实验成功率
超低的多重细胞干扰率
多次试验结果显示 1000 个细胞的多细胞率为 1%,10000 个细胞的多
细胞率为 4.7%
友好的数据分析软件
强大的自动化数据分析软件 Seqgeq 整合了多有操作系统,附带 R 语言
可根据数据选择不同的参数
发表文章
截止目前为止,BD RhapsodyTM 平台分别在《Science》、《Nature》和《Nature Methods》顶级期
刊共发表 3 篇高分文章。主要包括平台技术方法学总结、细胞异质性研究和大脑发育研究等内容(表 1)。
表 1. BD RhapsodyTM 平台已发表的文章
年份 |
期刊 |
影响因子 |
研究内容 |
2015.02 |
Science |
41.058 |
单细胞测序的细胞组合标记技术[1] |
2017.04 |
Nature |
41.577 |
单细胞测序验证装配好的前脑球体的功能完整性[2] |
2018.12 |
Nature Methods |
26.919 |
单细胞测序验证生成的皮质类器官的可靠性[3] |
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