测序峰图的高通量分析--Mutation Surveyor广州赢森生物科技有限公司

技术服务信息

服务名称:测序峰图的高通量分析--Mutation Surveyor
服务类别:分子生物学服务 - DNA测序服务
价格:询价
允许参观:不允许参与实验
所在区域:广东.广州
更新时间:2010/4/15 18:31:00
浏览人数:16964
诚信指数:5点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
点此求购 我要咨询
生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

供应商联系卡

广州赢森生物科技有限公司
地址:
广州天河
邮编:
电话:
020-23373723
传真:
020-23373723
联系人:
颜江辉
所在区域:
广东·广州
邮件:
公司展台:

技术服务详细描述

 

如有需要掌握此软件,本公司可提供指导。

Mutation Surveyor

 

Mutation Surveyor 是美国Softgenetics公司和中国华生恒业科技有限公司联合开发的Mutation/SNP检测软件,用来实现高通量(high-throughput),高灵敏度(sensitivity)和准确率(accuracy)DNA突变/SNP检测,目前已被全世界数百家知名机构使用(国外著名专家对Mutation Surveyor的评价和意见),在不到一年的时间内,分别在 Sciences Nature 已经出现了五篇文章报告应用MutationSurveyor(或MutationExplorer)研究 DNA 碱基突变的成果。

 

Mutation Surveyor在突变检测领域运用了两项世界首创的技术:

a)反相关曲线技术:该技术的运用使软件摆脱了传统突变检测软件对DNA碱基序列读取步骤(base calls)的依赖,Mutation Surveyor直接点对点地对比待测序列(sample sequences)和参考序列(reference sequences)DNA测序曲线(traces),产生反相关曲线,在比较待测DNA序列和标准参考序列时,使用5个不同参数作为突变判断标准。反相关曲线技术可以有效排除背景噪音的干扰,并对不同DNA测序仪产生的DNA测序曲线都可以准确分析。

 

b)准确识别插入/缺失杂合子突变(heterozygous indels):heterozygous indels突变的分析判断对于所有mutation检测软件来说都是一个挑战。Mutation Surveyor成功解决了这一世界性难题。

 

也许您遇到过这样一种情况,在做突变检测的样本序列中,序列5端一部分测序质量不错,然而从某一位置开始,测序峰图突然变的凌乱,而base call结果中含有大量错误信息或者N; 如果用一般的突变检测软件分析,该序列会产生多个假阳性突变。您可能会认为这是测序质量过差而抛弃这个结果,且慢,也许这就是一个heterozygous indels突变,即DNA双链中其中一条有一个或多个碱基的插入或缺失,造成其后面的序列峰形交错,无法读取。Mutation Surveyor会帮您找出其中***,乱峰被软件经过反相关处理后,将露出本来面目,野生型序列和插入/缺失突变型序列分别依次给出,可以看到突变型序列由于插入或缺失引起序列偏移,偏移的位数即插入碱基的个数。对比两种类型的序列,我们可以清晰看到突变碱基的峰形。

 

高敏感度

Mutation Surveyor对双向测序的结果分析十分精确,具有极高的敏感度(sensitivity)(>99.9),即使对单向测序结果敏感度也达到96以上。软件对杂合子突变的分析判断更有独到之处,对杂合峰高度大于主峰5的杂合突变都可以检出。用户从反相关曲线的峰形可以轻松得到突变位置及突变的各项参数。

 

各种突变结果显示

DNA双链变异一致性,基因变异可以分为纯合子突变(homozygous)、杂合子突变(heterozygous);按变异类型可分为插入突变(insertion),缺失突变(deletion)和碱基置换(substitution),可以从DNA序列图谱上看出。

 

 

高通量分析

Mutation Surveyor既适合分析小样本测序结果,也适合进行高通量分析。软件可一次性同步分析≥400条序列,并且支持先设定组别,自动分组处理任意数量的序列。您只需根据软件提示进行简单设定,剩下的由软件自动处理。

 

结果报告

Surveyor3种简明的格式报告分析结果:

1. 按照正向和逆转的序列对

2. 按照所有样本的全局分析

3. 单个样本分析

 

每种格式都被链接显示到电子影像分析图(electropherograms)中快速确认发现结果。

报告和electropherogram是链接的,electropherograms从上到下包括:正向的参照文件(reference)曲线,正向的样本文件(sample)曲线,正向的突变曲线,反向的参照文件(reference)曲线,反向的样本文件(sample)曲线以及反向的突变曲线。突变以尖峰的形式在正反突变曲线中清晰地表示出。

用户可以选择打印所用的样本也可以选择仅打印发生了突变的样本。

所有的数据能够容易的输出到LIMS系统或者电子数据表中。

Mutation Surveyor利用我们独特的数据压缩技术,以减少存储空间,把所有文件存为一个工程文件。

 

易用性,用户界面友好

软件充分考虑到功能的复杂性和操作的容易性的统一,虽然在内部通过复杂计算实现其分析功能,但是界面简单易用,适合生物学家及一般研究人员使用。

,,

,

生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

查看测序峰图的高通量分析--Mutation Surveyor 产品的用户还对以下产品感兴趣

  DNA测序服务   [供应商:南京金斯瑞生物科技有限公司]
  测序峰图的高通量分析--Mutation Surveyor   [供应商:广州赢森生物科技有限公司]
  HLA 基因分型检测   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  天津-DNA测序、全基因组学服务平台   [供应商:天津生物芯片技术有限责任公司]
  DNA测序   [供应商:上海基康生物技术有限公司]
  基因测序 DNA测序   [供应商:上海美吉生物医药科技有限公司]
  Sanger测序服务/测序/一代测序   [供应商:苏州金唯智生物科技有限公司]
  全基因组重测序(变异位点 遗传进化 基因预测)   [供应商:北京百迈客生物科技有限公司]
  焦磷酸测序   [供应商:上海希匹吉生物技术有限公司]
  DNA测序服务-高效快速   [供应商:天津生物芯片技术有限责任公司]

ADVERTISEMENT

找不到您所需的产品,发布求购试试?

标题:*
描述:
姓名:*
Email:*
单位:*
电话:*
地址:*
邮编:
资料: 需要 不需要
报价: 需要 不需要