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技术服务详细描述
环状RNA测序
环状RNA（circRNA）是一类特殊的非编码RNA分子，也是RNA领域最新的研究热点。与传统的线性RNA（linear RNA，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。近几年的研究表明，circRNA在生物的生长发育、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。由于circRNA的闭合环状特性，通过去除total RNA中的rRNA和线性RNA分子，可以特异地富集circRNA分子后测序，更有针对性地分析受检样本中特定的circRNA谱、circRNA剪接模式、组间差异和功能等。
欧易特色
● 应用范围广：可以检测几乎任何动植物的环状RNA
● 环状RNA全覆盖：高深度覆盖，可以检测到低丰度的稀有circRNA
● 专业化的生物信息学分析：强大的生物信息学团队，提供新环状RNA鉴定、环状RNA功能预测、环状RNA分子标志物筛选等深入分析易读性强的数据报告
项目流程
获取total RNA---RNase R 消化线性RNA---纯化后去除rRNA---测序文库构建---上机测序---原始测序数据---数据质控---数据分析
推荐测序模式
● Hiseq4000，PE150 ● 推荐10 Gb/样本
样品要求
● ≥22 μg（建库需求量为20 μg） ● OD260/280为1.8-2.2
● 适用范围：有参考基因组的真核生物
数据分析内容
标准数据分析
● 原始测序数据质控 ● 测序数据质量评估 ● Reads污染检测 ● circRNA鉴定
● circRNA来源基因注释 ● circRNA基因结构分析 ● circRNA的表达丰度 ● circRNA差异表达分析
高级数据分析
● circRNA-miRNA互作分析、互作网络图绘制 ● ceRNA分析 ● WGCNA分析
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