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Small RNA深度测序

Small RNA深度测序

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产品名称: Small RNA深度测序

英文名称: high throughput sequencing of small RNA

产品编号: 高通量RNA测序02

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上海美吉生物医药科技有限公司
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       Small RNA是一类长度在20~30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。Small RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中起着关键的作用。第二代高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性产生上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异。

美吉优势

★ 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。

★ 技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。

★ 拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

 

生物信息分析

1. 序列去杂(去除接头序列、简单序列等)

2. Rfam数据库以及Genbank数据库比对,去除rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的降解片段

3. 鉴定mRNA的降解片段

4. 同miRNA数据库比对,鉴定miRNA

5. 同参考基因组比对,预测新的miRNA

6. 分析两个样品miRNA的表达差异

7. miRNA表达模式聚类分析

8. 预测miRNA靶基因