单核苷酸多态性(SNP)检测上海捷兰生物技术有限公司

技术服务信息

服务名称:单核苷酸多态性(SNP)检测
服务类别:分子生物学服务 - SNP检测服务
价格:询价
允许参观:允许参与实验
所在区域:上海.上海
更新时间:2017/9/19 10:43:00
浏览人数:10340
诚信指数:471点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海捷兰生物技术有限公司
地址:
漕宝路500号4号楼4206室
邮编:
200233
电话:
021-54971019
传真:
联系人:
田先生
所在区域:
上海·上海
邮件:
公司展台:

技术服务详细描述

 

简介:单核苷酸多态性(SNP)是指有单个核苷酸替代、插入或缺失而形成的分子形态,有时包括有多个核苷酸插入或缺失造成的点突变。SNP检测在临床及临床相关研究中已有广泛应用。

单核苷酸多态性(SNP)检测

 

■ 检测方法
双标记探针法,飞行质谱法,焦***酸测序法
■ SNP装置

双标探针法:本公司使用美国ABI公司的Step-one-Plus realtime PCR System为主的Real-Time PCR装置。

飞行质谱法:使用美国ABI公司的4700API MALD2/TOF飞行时间质谱仪
焦***酸测序法:使用德国QIAGEN公司PyroMark Q96 ID装置

 
 双标探针法

 技术原理:

     

    这种方法可以直接在实验结果(软件自动输出的Excel表格)中读出每个样本中SNP位点的基因型(纯合子XX或YY,杂合子XY),不需要再对序列进行分析,具有直观性。   

操作程序 :   

■  由您提供目的基因的相关资料(基因名称、序列、SNP位点分布等),共同探讨服务的可能性和技术路线。   

■  由您提供实验所需的足够量的实验样本,一般为抽提好的基因组,如委托本公司抽提基因组,费用另计     

设计并合成探针及引物

■  进行Real-time PCR实验

■  提供实验结果(散点图和excel表格)和实验报告,如下图

    

 
 飞行质谱法

 检测原理:

    主要是利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 进行分析,即PCR扩增产物或者预处理样本在延伸单碱基后,将制备的样品分析物与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s)强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率得以分离,在真空小管中飞行到达检测器。MALDI产生的离子常用飞行时间(Time-of-Flight,TOF)检测器来检测,离子质量越小,就越快到达。理论上讲,只要飞行管的长度足够,TOF检测器可检测分子的质量数是没有上限的。

 检测程序:

♦  客户提供样本及检测位点信息

♦  样本完整性检测以及前处理

♦  引物设计、合成

♦  PCR扩增、SAP纯化、延伸

♦  点样并进行质谱分析

 

焦***酸测序法

优势:

♦ 单一位点的质量评估和序列信息

♦ 分析含有CpG位点的SNP

♦ 序列信息中不同位点的频率计算

♦ 适用于新鲜冷冻,和石蜡包埋的样本

♦ 不同的应用实验可同时在一次运行中实现

♦ PCR反应之后,1个小时内可同时平行分析96个样本

 实验流程:

实验结果实例:

 
    服务要求
 

进行SNP分析时,请寄送足量的并且保证纯度的Total DNA(浓度在500 ng/μl以上,体积在 20 μl以上)。如果目的基因表达量低时,应尽量提供更高浓度的Total DNA。
如果提供的材料为细胞或组织,DNA的提取费用另收。 同时应保证材料新鲜,动物细胞数为106以上,动物组织为100 mg以上

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