动植物基因组重测序上海迪奥生物科技有限公司

技术服务信息

服务名称:动植物基因组重测序
服务类别:微生物学服务 - 其它
价格:询价
允许参观:不允许参与实验
所在区域:上海.上海
更新时间:2017-4-11 13:59:00
浏览人数:3345
诚信指数:484点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海迪奥生物科技有限公司
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联系人:
胡小姐
所在区域:
上海·上海
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技术服务详细描述

动植物基因组重测序

 

在已知物种基因组的情况下,对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序,可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法,可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel,Insertion Deletion,结构变异位(SV,Structure Variation),拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)等变异信息,从而获得生物群体的遗传特征。这对在群体水平上研究物种的进化历史,环境适应性,自然选择等方面具有重大意义。利用全基因组重测序有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异,缩短分子育种的实验周期;有助于发现人类疾病相关的重要变异基因,加快生物医药研发的速度等。可以预期随着测序成本的进一步降低以及已知全基因组序列物种的增加,重测序必将成为生命科学领域的研究利器。

 

迪奥优势

 

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。

 

拥有Roche454IIIumina Solexa两种高通量测序平台,合作伙伴可根据具体需求进行选择,以获得最佳的实验结果。

 

技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案,解决实验问题,分析实验结果。

 

拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

 

 

 

 

 

生物信息分析

 

 

1. 原始数据统计

 

2. 短序列mapping至参考基因组

 

3. 分析mapping区域reads的覆盖度,重复性,覆盖碱基的质量及reads方向

 

4. SNPs,InDel,CNVS检测

 

5. 结构变异(SVs)和基因组重排事件分析

 

 

 

 

 

实验周期

 

 

迪奥生物从获得合用伙伴样品到高通量测序,一般控制在40个工作日左右完成。

 

送样要求

 

1. DNA样品:浓度>=100ng/ul,总量>=50ug.OD值在1.8-2.0之间,样品浓度越高越好。

 

2. 植物样品:需要黑暗无菌条件下培养的黄化苗,组培样品或嫩苗。

 

3. 动物样品:应挑选肌肉,血等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续

生物信息分析产生的影响,应尽量从同一个体中取样,若物种体积较小,从一个个体提取的DNA量不够进行一次测序反应,在保证量的情况下,应尽量减少个体的个数。

 

4. 请填写完整的送样订单,用自封袋密封后随同样品一起送样。

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