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LncRNA芯片全面解决方案

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产品名称: LncRNA芯片全面解决方案

英文名称: LncRNA Chip

产品编号: BT10003

产品价格: 5500-6500

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品牌商标: null

更新时间: null

使用范围: null

上海阿趣生物科技有限公司
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在人的基因组中,只有2%碱基用于编码蛋白,而有72%的碱基是可以转录的,因此ncRNA的存在有很大的空间。然而这些不编码蛋白的RNA(ncRNA)有什么作用呢?近些年,研究者们主要将目光聚集在短的ncRNA(miRNA)上,已经发现了数千个miRNA,其主要功能是调节基因的表达。但是我们不能忽视更长一些的也具有重要功能的long ncRNA。Long ncRNA (lncRNA) 是一类转录本长度超过200nt的RNA,它们本身并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上调控基因的表达水平,已知作用则包括基因沉默、基因印记和反义抑制。随着近年来lncRNA不断被发现,人们开始关注LncRNA在各种生物学过程以及疾病中所起到的作用。通过lncRNA芯片,研究人员能够快速高通量的获得与特定生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化。
一、技术路线和方法:

二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01:原始数据预处理与均一化
Part02:差异lncRNA筛选
Part03:聚类分析(层次聚类)
Part04:差异lncRNA靶基因预测
Part05:靶基因GO分类
Part06:靶基因Pathway分析
2.2 高级数据分析
Part08:差异lncRNA转录因子结合位点分析
Part09:差异lncRNA与靶基因调控网络
Part10:转录因子、lncRNA、靶基因互作网络
Part11:目标基因反向预测lncRNA
Part12:lncRNA引物设计

三、芯片平台

芯片平台
(Human)
型号 lncRNA\lincRNA数量 规格 货号
Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K 7419条lincRNA 8×60K BT1000311
27958条mRNA

 

芯片平台
(Mouse)
型号 lncRNA\lincRNA
数量
规格 货号
Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K 16251条lincRNA 8×60K BT1000321
39430条mRNA


五、完成时间
2个月,(其中生物信息分析1个月)
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