CSAM-08:转录因子-靶基因关联分析

本方案是根据转录因子结合位点( TFBS )与转录起始位点( TSS )之间的距离来定量估计转录因子( TF )与靶基因基因的关联调控强度,即预测调控关系强度...

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CSAM-07:多转录结合位点组合分析

对于不同 TF 的结合位点会出现共同定位的情况,本方案可以分析区别哪些转录因子( TF )的DNA 结合位点(简称 TFBS) 是真实地具有组合共调控功能的,哪些 TFBS 的共调控是随机产生。

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CSAM-06:ChIP-Seq 转录因子结合位点的基序分析

为了解蛋白结合 DNA 位置序列(例如转录因子 DNA 结合位点,称为 TFBS )的特异性,本方案将对蛋白因子的强结合峰值上下游 100bp 区间内序列进行从头探测( Motif 识别)。

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CSAM-05:ChIP-Seq关联DNaseI-Seq测序数据

DNaseI, 即 脱氧核糖核酸酶(Deoxyribonuclease),是一种可以消化单链或双链DNA产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。

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CSAM-04:ChIP-Seq 关联基因表达数据

本公司具有丰富的组蛋白与转录因子实验与信息处理能力,深度解析表观组与转录组之间存在的关联调控规律。分析内容是将蛋白结合峰( Peak )与样本在对应实验条件下获取的表达谱数据进行关联分析...

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CSAM-03:基因临近区域结合峰分布特征分析

本方案是统计分析处理组样本相对照组所富集到的峰( peak )区域内测序片段 Reads Tags 的分布

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CSAM-02:ChIP-Seq 异蛋白结合峰分析

本方案是对每组对比样本之间计算差异的结合峰区域。

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CSAM-01:ChIP-Seq 结合峰的识别

本方案针对 ChIP-Seq 实验获取的蛋白结合区域的测序片段进行基因组比对分析,并采用高效的蛋白结合峰( Peak )识别算法精确定位结合峰的位置与峰强度( peak height )。

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App Chip-07 DNA甲基化芯片解决方案

高密度的升级版 Human 450K 甲基化芯片实验服务与配套下游综合数据分析服务将围绕DNA甲基化组进行系统的生物学问题的探索。

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App Chip-06 基因调控网络预测

系统全面地识别顺式转录元件(cis-regulatory element)是重构基因调控网络的重要途径。该解决方案是将系统识别了差异表达基因中潜在受到调控的基因及其相应的结合位点。

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App Chip-05 癌症生物通路特征分析

癌症发育状态是一个复杂的过程,涉及到导致细胞信号通路的多个独立突变的发生使得细胞生长和命运控制失控。

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App Chip-04 GSEA基因特征富集分析

通过均值比较在整个基因组上基因的表达情况可以大致估计差异变化的基因数量和分布情况,然而并不能提供对差异变化基因参与的生物学通路和功能的分析。

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