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Progenesis SameSpots

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产品名称: Progenesis SameSpots

英文名称:

产品编号: 2.6

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产品产地: 英国

品牌商标: Nonlinear Dynamics

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上海康昱盛信息科技有限公司
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产品特性

简单性

利用一个优化的且简洁的工作流引导用户进行一系列的分析步骤,并最终轻松地找到有显著性变化的蛋白。

准确性

引导性的工作流使得整个分析遵循一个统一的流程,让新用户或者没有经验的用户也能用他们的2D胶分析中得到完全客观准确及可重复的结果。

速度

归功于高度流程化及优化的工作流,每个图像的分析时间都在5分钟以下。



SameSpots 方法的独到之处

SameSpots的方法是一个独特且经过认证的,对于单株或者DIGE图像的分析特别有优势。

SameSpots用了极其精确的技术,甚至可以实现图像中每个像素的完美叠合。于是,您的所有图像的点都能100%叠合,分析数据里面也不会有丢失的值。从而使您的结果在统计上非常可信的,产生的结果也同样完全可以让用户信赖。

在完美叠合的图像上进行点识别的功能,也意味着在大多数实验中不再需要图像点的手工编辑,因此操作人员的偏差可以被降到最低。分析如此之快使您能在瞬间就鉴别出显著性的蛋白质。



Progenesis SameSpots – 工作流主要步骤:



l 图像质量控制


在工作流起始阶段的自动图像质量控制评价及反馈,可以在您进行下一步分析前就能发现一些潜在的问题,引起分析人员注意



l 图像叠合


先进的图像叠合可以引导您按逻辑的方式把向量标记加入到胶的图像上,而自动的叠合分析过程则用这些标记把所有的实验图像进行叠合



l 控制检测参数

叠合的格点图使得凝胶图像上失真得最厉害的问题区域能够引起您的注意,以便于在系统的叠合检查时,您能够集中于这些区域。如果需要,叠合能够进行手工的调整。你可以选择图像,针对这些图像来进行后续的分析。

l 自动分析

您可以在一步之内完成整个实验分析,每张胶只需几分钟。这个可靠迅速的分析过程包括SameSpots检测、背景去除、正规化以及匹配。

l 过滤


有些您不想加进来的瑕疵可以在SameSpots分析里面过滤掉。同时你还可以选择区域不进行分析,例如破损、噪声、边缘的区域。



l 正规化


你可以在散点图上查看正规化的结果以及每张图的正规化因子,并可以做相关的校正。为了增加灵活性,你也可以不做任何正规化(只针对非DIGE实验)。





l 实验设计


针对所有的比较建立实验设计。你可以选择建立“between-subject”和”within-subject”两种实验设计。





l 浏览结果

你可以浏览所有结果。Spots按照ANOVA分析p-value来排序,并赋予一个独一无二的ID,无论你的实验设计是否改变。在大多数情形下,你并不需要编辑图片分析。然而,如果你的图片需要编辑点,只需在一张图片上实施,结果即可应用于所有2D图片。






l 统计分析

Progenesis Stats是一个非常容易使用的工具,你可以用它来进行强大的统计分析,以得到可靠的结论。主成分分析(PCA)、相关性分析、统计效能分析和q-values(p-value假阳性率调整)都包括在这个分析模块中。






l 等电点和分子量校正

这个校正特性允许你通过分子量或已知蛋白来快速校正点,图像可以用分子量和等电点值来标记。

l 来自外部统计分析包数据导入

l 点选择(Spot Picking)

独一无二的比对允许你比对并分析图片,并可立即应用于胶选择上来选择精确的点位置。这个工作流支持手工选点,或是GelPix, ProPic,Ettan这些选点机器人。




l 分享结果

最终报告提供了关于整个蛋白点的概要,显著的、感兴趣的或选定的点。输出报告可以保存下来最为参考。





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