染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。

ChIP-Seq的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。基于此，我们推出ChIP-Seq的完整解决方案，协助您一起探索生物奥秘。

技术路线

生物信息学服务

样品要求

1）DNA纯度：OD 260/280值应在1.8～2.0 之间; 

2）DNA总量：每个样品总量不少于30ng；

3）DNA的保存溶剂：H20或TE (pH 8.0)中；

4）样品运输：冰袋运输，且在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染。

5）建议在条件允许情况下，提供可供两次样品制备的量，以确保实验质量及延续性。

应用领域

Ellen Markljung 等利用 ChIP-Seq 技术,发现：家猪 IGF2 基因（编码 Insulin-like growth factor 2 ）第三内含子单碱基 G→A 的替换,导致抑制因子 ZBED6 在该基因上结合位点的丧失,从而使 IGF2 在骨骼肌中上调表达（表达量是正常情况的 3 倍）,这一突变主要影响肌肉生长（提高了骨骼肌的数量,因此猪肉产量提高了 3~4% ）、心脏增大和脂肪沉积。

参考文献

[1]Mitchell JA, Clay I, Umlauf D, et al. Nuclear RNA sequencing of the mouse erythroid cell transcriptome. PLoS One, 2012, 7:e49274.

[2] Zong W, Zhong X, You J, Xiong L, et al.Genome-wide profiling of histone H3K4-tri-methylation and gene expression in rice under drought stress.Plant Mol Biol, 2012, [Epub ahead of print]