ATAC-seq高通量测序数据分析
产品名称： ATAC-seq高通量测序数据分析
英文名称： ATAC-seq
产品编号： ATAC
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品牌商标：
更新时间： 2023-11-30T00:11:20
使用范围： null
上海问组生物科技有限公司
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ATAC-seq（Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughput sequencing）是结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。该方法由斯坦福大学的 William J. Greenleaf 和Howard Y. Chang在2013年共同开发。在 ATAC-seq 实验中，通过高活性 Tn5 转座酶将测序接头插入染色质的开放区域，然后进行测序，通过测序数据推断染色质区域的可及性，并可以计算转录因子结合位点和核小体的区域位置等。
问组生物ATAC分析主要包括：
1.原始数据质控
2.片段长度分布质控
3.样品相关性
4.富集峰鉴定和注释
5.富集峰长度分布
6.TSS周围reads分布热图
7.Motif分析
8.差异分析
9.GO富集分析
10.KEGG通路富集分析
11.可视化