环境中微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点。长期以来，由于受到技术限制，对微生物群落结构和多样性的认识还不全面，对微生物功能及代谢机理方面了解的也很少。但随着高通量测序、基因芯片等新技术的不断更新，微生物分子生态学的研究方法和研究途径也在不断变化。第二代高通量测序技术的成熟和普及，使我们能够对环境微生物进行深度测序，灵敏地探测出环境微生物群落结构随外界环境的改变而发生的极其微弱的变化，对于我们研究分析微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重要的理论和现实意义。

       微生物多样性的研究涉及农业、土壤、林业、海洋、矿井、人体医学等诸多领域。以在医疗领域的应用为例，通过比较正常和疾病状态下或疾病不同进程中人体微生物群落的结构和功能变化，可以对正常人群与某些疾病患者体内的微生物群体多样性进行比较分析，研究获得人体微生物群落变化同疾病之间的关系；通过深度测序还可以快速地发现和检测常见病原及新发传染病病原微生物。

技术优势

1. 采用隶科基因独有的BioinfoSct^TM生物信息技术分析数据
2. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠
3. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为客户提供个性化的生物信息分析服务
4. 技术专家经验丰富，可以根据客户要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果

技术应用

宏基因组测序分析牛胃微生物基因组

通过研究牛的消化机制，来寻找可用于生产第二代生物燃料的酶。 研究者将柳枝稷样品置于牛的瘤胃中培养72小时，然后对附着在柳枝稷样品上的所有微生物进行宏基因组测序（268G）。获得了大量碳水化合物活性基因，对其中部分基因表达后得到产物进行研究，发现57%蛋白酶产物对植物中的纤维素显示出活性， 属于可分解纤维素的酶。此外通过测序结果组装了15种无法培养的微生物基因组，并通过其他方法得到证实。

Metagenomicdiscovery of biomass-degrading genes and genomes from cow rumen. Science.2011 Jan 28;331(6016):463-7.

土壤微生物群落和功能的宏基因组分析

通过宏基因组测序的方法分析了16个微生物群落的组成和功能，它们包括寒漠土、热漠土、森林、草原和冻原。没有植被的寒漠土功能多样性和物种多样水平最低。荒漠群落中与渗透压调节和休眠相关的基因相对丰度高，但是与营养循环和植物有机物代谢的基因相对丰度较低。荒漠土中抗生素基因比非荒漠土小三倍，由此推测非生物因素在荒漠微生物群落形成过程中起到更重要的作用。该研究表明宏基因组方法可以解析陆地环境微生物群落及功能多样性的变化。

Fierer N, Leff J W, Adams B J, et al. Cross-biome metagenomic analyses of soil microbial communities and their functional attributes. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2012, 109(52): 21390-21395.