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细菌全基因组测序及生物信息学分析

细菌全基因组测序及生物信息学分析

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产品名称: 细菌全基因组测序及生物信息学分析

英文名称: bacterial de novo sequencing

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北京诺赛基因组研究中心有限公司
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 技术简介: 
       从头测序即 de novo  测序,不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列,从而推进该物种的研究。 

生物信息分析: 
1.       原始序列预处理和拼装; 
2.       填补Gap获取精细图或完成图; 
3.       基因组组分分析,包括各类ncRNA、重复序列和转座子等; 
4.       基因结构预测及功能注释; 
5.       蛋白结构域注释; 
6.       生化反应通路图(PATHWAY)映射; 
7.       基因本体论(GO)注释; 
8.       特异序列、特异功能蛋白等的预测。 

送样要求:

样品 要求
DNA 小片段文库: ≥5ug;2kb~5kb≥40ug;10kb≥60ug
浓度 小片段文库: ≥50ng/ul;2kb~5kb≥150ng/ul;10kb150ng/ul
纯度 OD 260/280 =1.8~2.0 ;无蛋白及RNA 污染