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生物信息学数据分析服务

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产品名称: 生物信息学数据分析服务

英文名称: bioinformatics data analysis services

产品编号: BDAS

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更新时间: 2023-11-30T10:07:38

使用范围: null

上海问组生物科技有限公司
  • 联系人 : 余老师
  • 地址 : 上海市奉贤区金海公路6055号11幢5层  
  • 邮编 :
  • 所在区域 : 上海
  • 电话 : 139****6049
  • 传真 :
  • 邮箱 : ding@bioinformatics.com.cn

常见个性化分析列表:

GEO相关服务:

1,芯片数据挖掘。根据芯片类型,计算表达谱,差异基因等

2,高通量测序数据挖掘。根据测序类型,计算表达谱,差异或者peak calling等

3,多组学数据联合分析

4,GEO原始数据上传/下载

TCGA相关服务:

1,特定癌症的表达谱,差异分析

2,Cox回归,生存分析

3,预后模型

4,免疫浸润

转录组相关:

1,GSEA/GSVA分析

2,CNC共表达网络分析

3,ceRNA网络分析,包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络等

4,WGCNA分析

5,GO,Pathway分析,常规物种和特殊物种

6,蛋白质-蛋白质相互作用分析

7,hub基因分析

8,circRNA同源分析

9,时序表达分析

10,Venn图

11,PCA分析

测序服务:mRNA-seq  小RNA相关

1,miRNA靶基因预测

2,miRNA-靶基因网络分析

3,miRNA二级结构分析

4,piRNA靶基因预测

测序服务:miRNA-seq  ChIP、MeDIP相关

1,峰可视化

2,motif分析

3,circos图

MeRIP/m6A相关

1,m6A和RNA-seq联合分析四象限图

2,相关系数

3,peak venn图

4,circos图

5,motif分析

6,metaplot

eccDNA相关

1,eccDNA长度分布

2,motif分析

3,染色体分布

4,不同基因组特征分布

其他联合分析:

1,RNA-seq和MeRIP-seq联合分析

2,miRNA-seq和circRNA-seq联合分析

3,mRNA-seq和eccDNA-seq联合分析

个性化作图、分析相关:

1,提供论文例图定制开发

2,提供数据,测试程序等