5-1、表达组测序:

（1）单个样本的深度测序:特定组织或者细胞中的mRNA分离后制备成片段化的cDNA文库，通过solexa测序仪对cDNA文库高通量测序，从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息。 

5-2、miRNA测序 : 可对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。用于作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。

5-3、基因组测序:

（1）细菌基因组测序:对细菌基因组进行全测序研究。  

（2）真菌全基因组测序:对于真菌全基因组而言，可以得到到一个真菌基因组的精细图（基因组覆盖度大于95％，基因区覆盖度达到98％以上，单碱基错误率低于十万分之一）。     

（3）全基因组重测序：全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行    测序，并在个体或群体水平进行差异分析的方法。基于全基因组重测序的分子育种，能够快速的进行种质资源普查筛选，寻找到大量基因差异，实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测。在全基因组水平上扫描并检测与动植物重要性状相关的突变位点，具有重大的科研价值和产业价值。

5-4、基因测序实验步骤：

（1）       各种核酸提取实验：详见核酸提取实验步骤。

（2）   制备各种基因库如基因组文库、转录组文库、microRNA文库。

（3）   将上述测序样品加入到测序仪中进行各种测序反应。