De novo 不用任何参考序列对某个物种进行测序，用生物信息学方法进行组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。Illumina Genome AnalyzerⅡx和GS FLX Titanium系统是目前进行de novo 测序拼接基因组非常先进和经济的平台，既可进行整个基因组序列测定也可进行基因组上一个大片断候选区域的序列测定。对于细菌、真菌等基因组测序，Solexa 和GS FLX Titanium 或者两者的组合是非常好的选择，使得基因组测序成本及基因组组装难度均大大降低，缩短了测序时间。对于动物和植物基因组，Solexa mate-pair 和GS FLX Titanium (Pair-End, 插入片段3k,8k 和 20K) 是最经济，快速的方法。
 

基因组框架图：(1)基因组覆盖率大于90%; (2) 基因区覆盖率大于95%; (3) Contig N50 大于5Kb; (4) Scaffold N50 大于20Kb; (5) 单碱基错误率万分之一以下

基因组精细图：(1)  基因组覆盖率大于95%; (2) 基因区覆盖率大于98%; (3) Contig N50 大于20 Kb; (4) Scaffold N50 大于300 Kb;(5) 单碱基错误率万分之一以下

样品要求：     
  1. 植物要求是黑暗无菌条件下培养的黄化苗或组培样品，最好为纯合或单倍体。
  2. 动物样品应选用肌肉，血等脂肪含量少的部位，同一个体取样，最好为纯合。
  3. DNA样品OD值应在1.8～2.0之间，样品浓度越高越好，；基因组de novo 测序DNA总量不低于500ug。

技术路线：

服务内容：

  1. 细菌、真菌、动植物全基因组测序；
  2. 基因组组装、功能注释、比较基因组及分子进化分析等。

服务方式：

  1. 我公司提供454和solexa测序并进行组装
  2. 客户提供按照我们的要求提供测序数据，由我们公司进行组装