基因分型-分子生物学服务 -技术服务-生物在线
基因分型

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产品名称: 基因分型

英文名称: Snp Scan

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更新时间: 2023-08-17T13:40:59

使用范围: null

翌圣生物科技(上海)股份有限公司
  • 联系人 : 李自转
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        上海前尘生物工程有限公司技术服务类项目再添一道风景线!基于前尘公司过硬的修饰引物合成技术、测序技术、PCR技术,20074月推出的SnpScan 基因分型服务,为SNP的研究提供了一种更灵敏,更高效,更准确的检测方法。

一、 技术原理与依据:
        SNP(single nucleotide polymorphism
,单核苷酸多态性)是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90% 以上。根据人类基因组有3 x109bp,估计人体中有300万个SNPSNP在基因组水平上由于单个核苷酸位置上存在转换(CT互换,在其互补链上则为G与A互换)或者颠换(C与A,G与T,C与G,A与T互换)等变异引起的DNA序列多态性。SNPs在基因组分布(500-1000bp/标记),比RFLPSTR6000-7000个多marker)多。由于SNP在人群中为二等位基因性,特别是在编码区的cSNP稳定性高。 部分位于基因内部的SNP可能会直接影响产物的蛋白质结构或者基因表达水平,可能是疾病遗传机制的候选改变为点。

二、应用领域
全基因组的高密度遗传分析
寻找疾病相关基因的突变位点;
通过对药物靶点的个体差异性分析,调整个体用药的种类和剂量;
人群进化史研究等等方面。

SNP基因分型研究包括SNP发现(discovery)、SNP验证(validation)以及SNP筛选(Screening or Scoring)。

三、服务特色:

       前尘生物公司拥有一整套以AMLRAllelic-specific Multiplex Ligase-detection Reaction)技术为基础的,高度精密高效的SNP Scan基因分型服务体系,可以为客户提供从小样品规模(如200样品/位点)至大样品规模(上千样品/位点)的SNP基因分型服务。

需提供样品

        血液,细胞组织等样品DNA、具体的SNP位点以及位点侧翼200bp序列,我们即可以将其SNP检测结果提交。上海前尘生物接收SNP样品的形式有两种:

1.DNA样品
要求:待检测DNA样品浓度要相对均一,DNA样品浓度在10ng/ul-50 ng/ul之间,体积≥20μl,用双蒸水或者TE缓冲液溶解,不含PCR抑制剂。务必注明样品的准确浓度。

为了保证样品质量能够达到SNP检测的要求,正式实验前我们需要对样品DNA浓度与质量进行鉴定:

1)如果客户未提供准确的DNA浓度信息,我们会对每个样品进行浓度检测并根据检测结果进行浓度调整(浓度测定每个样品收费1元);

2DNA质量鉴定:随机选取10个样品,用我们公司已有的高频率SNP位点所对应的引物探针进行SNP分型实验,此鉴定实验共收费200元。我们会将DNA鉴定结果及时告知客户并共同决定是否进入正式实验。

2.血液样本
可以用加有EDTA抗凝剂的真空管采集,采集后放入-20度冰箱保存,体积大于2mlDNA抽提的费用,每个样本人民币10元。

3.样品要求

DNA样品运送过程中请用冰袋,保证DNA不降解。血液样本的保存方式:
为了达到最佳的效果,最好使用新鲜的标本或者冰箱4°C存放3天以内的标本,不要使用反复冻融超过3次的标本,否则会严重降低DNA抽提产量,直接导致SNP分型失败。

4.其他要求

1)为方便探针及引物设计,请提供(a)SNP检测位点上下游各200个碱基的基因组DNA模板序列及其序列号,(b)注明在此范围内之所有其它SNP位点。
2)
请用E-Mail传送,勿用传真。请尽量提供待测SNP位点的三种基因型的标准样品。
3)
请务必提供待检测SNP位点在采样人群中的等位基因频率信息,如果是中国人群,必须提供中国人群频率信息。
4)
单位、地址、电话、电邮等信息务必填写清楚,以便我们给您发送实验报告并及时沟通。

五、服务流程

六、客户将得到的数据:
1SNPs结果(Execl表格)
2
、实验过程中涉及的电泳图,测序峰型图
3
、扩增和反应体系所设计的引物序列
4
、客户所需的其他资料

七、结果示例

                           一般分型方法                 前尘AMLR方法

Figure1 一般分型方法和捷瑞的AMLR方法分型结果比较

Figure2:前尘AMLR方法的分型结果