北京与翔科飞生物信息科技有限公司
- 联系人 :
- 地址 : 北京市海淀区中关村东路1号清华大学南门外文津国际公寓1504
- 邮编 :
- 所在区域 : 北京
- 电话 : 135****3131
- 传真 : 010-62790556
- 邮箱 : service@co-fly.net
芯片质量控制 (Quality control) 通过对数据的各项指标的分析作图，可以评估芯片实验质量，了解数据的分布规律，并为下一步分析方法提供参考。
读取基因型(Genotype call) 从CEL文件读取SNP基因型数据
探针质控(Quality control) 通过多种统计学算法过滤掉部分不适宜进入下一步分析的探针。
DNA拷贝数变化(CNV)以及杂合性缺失分析(LOH)分析
基因型分析（Genotype） 基于卡方检验等统计学分析，筛选在两组或多组样本中存在分布频率差异的SNP位点。Manhattan图可以用来观测各个染色体中显著差异SNP探针的数据分布。
主成分分析(PCA)
全基因组关联分析 (GWAS) 与翔自主开发了使用多种智能机器学习算法的GWAS分析流程。经过对数百套孤独症样本和HapMap对照数据集的分析测试，对独立样本的准确率可以达到92。ROC曲线线下面积为0.9558。