长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），广泛存在于各种生物体内。lncRNAs参与表观遗传、转录以及转录后等多水平的调控过程，在生命活动中具有重要作用。推出的lncRNA测序服务，使用高通量测序技术结合先进的生物信息学分析，一次性获得样本中几乎全部的lncRNAs信息，为您全面、深入地研究lncRNAs的功能提供了全新的工具。

技术优势

1. 技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993；
2. 基于高通量测序技术，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息；
3. 不局限于对已知lncRNA的研究，还可进行novel lncRNA的预测；
4. 除人和鼠外，还可应用于其他真核物种，可共同制定定制化研究方案。

研究内容

1. 标准信息分析

　　1）去除接头污染、低质量序列得到clean data，去除核糖体RNA数据，数据产出统计及测序数据质量评估；

　　2）转录本组装；

　　3）鉴定已知lncRNA（客户可提供数据库，若没有要求，人和小鼠默认NONCODE数据库）；

　　4）鉴定蛋白编码序列（客户需提供蛋白数据库链接，默认比对COG、KEGG、Nr、SWISS-PROT蛋白数据库）；

　　5）预测新的lncRNA（不保证lncRNA预测结果，预测方法可按照客户要求进行调整，需个性化评估收费）；

　　6）lncRNA家族预测分类（6-7条分析针对所有lncRNA，如不进行novel lncRNA预测则仅针对已知lncRNA）；

　　7）lncRNA定量及差异分析（差异分析需2个或2个样品以上）。

2. 定制化信息分析（需要mRNA表达量数据，并且需要根据样本数量等进行评估）

　　1）CNC（coding-non-coding）共表达注释；

　　2）Pathway富集分析；

　　3）结合客户的需求，协商定制其它定制化信息分析内容。

技术参数

一、样品要求

                                                        表1 样品质量判定标准

说明：

Level A：A类样品，指的是质量满足建库测序要求，且总量可以满足2次或者2次以上建库需要的样品。

Level B：B类样品，指的是质量满足建库测序要求，且总量可以满足1次但不足2次建库需要的样品。

二、项目运转周期

标准流程的运转周期约为50个工作日（20对样本以上需额外增加时间）。

三、项目合格指标

产生不低于合同规定的clean data。