华联miRNA基因芯片上海吉凯基因医学科技股份有限公司

人类miRNA芯片Human miRNA OneArray ^®  v5 
       
    人类 miRNA 芯片 v5 延续 v4 的设计原理， 参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计， 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v5 版芯片于 2013 年 7月正式上线。

 

探针信息

人类miRNA芯片v5探针内容
学名	Homo sapiens
常用中文名称	人类
探针代表号	hsa
常用英文名称	Human
miRNA探针数	2,003
总所对应的成熟miRNA数	2,019
miRNA探针重复数	3
控制探针数	144
总探针数	6,153

 

基因探针 
    人类 miRNA 芯片 v5 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计， 共有 2,003 个序列，可对应到 2,019 个成熟的 miRNA， 在探针设计的过程，依据各序列的特性，进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上，每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。

 

控制探针 
    为确保芯片数据质量，华联技术团队经过一连串的测试及验证， 设计一系列的质量控制探针，以***完整的芯片实验步骤，包含样本RNA完整性、样本RNA放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。

 

小鼠&大鼠miRNA芯片 Mouse&Rat miRNA OneArray^® v4 

    小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 延续 v3 的设计原理， 参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计， 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v3 版芯片于 2012 年 3 月正式上线。

 

探针信息

小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 探针内容
学名	Mus musculus	Rattus norvegicus
常用中文名称	小鼠	大鼠
常用英文名称	Mouse	Rat
探针代表号	mmu	rno
miRNA探针数	1,129	676
所对应的成熟miRNA	1,157	680
RmiOA v3 miRNA探针总数	1,362
RmiOA v3 所对应的成熟miRNA总数	1,837
miRNA探针重复数	3
控制探针数	144
总探针数	4,230

 

基因探针 
    小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计， 共计 1,362 个序列， 可对应到 1,837 个成熟的 miRNA， 在探针设计的过程，依据各序列的特性，进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上，每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。

 

控制探针 
    为确保芯片数据质量，华联技术团队经过一连串的测试及验证， 设计一系列的质量控制探针，以***完整的芯片实验步骤，包含矩阵校准标记探针、 阳性控制探针及阴性控制探针。

 

  华联生物芯片探针设计主要以Sanger miRBase的资料库为主，依资料库的更新状态，定期提供新版本探针内容的人类、小鼠与大鼠的标准miRNA芯片，详细规格如下表：

 

miRNA芯片	基因探针数	对应miRNA数	控制探针数	探针重复数	参考数据库
HmiOA v3 Human miRNA OneArray	1,711	1,732	105	3	Sanger miRBase v17
RmiOA v3 Mouse & Rat miRNA OneArray	Mouse 1,080	Mouse 1,111	105	3	Sanger miRBase v17
	Rat 680	Rat 672
MPmiOA v3 Model Plant miRNA OneArray	1,022	1,817	105	3	Sanger miRBase v17