比较基因组杂交芯片(aCGH)技术服务上海康成生物工程有限公司

性能参数

产品名称: 比较基因组杂交芯片(aCGH)技术服务
英文名称: aCGH Service
产品型号: Roche-NimbleGen
产品规格: 244K and 385K
产品产地: 美国
品牌商标: Roche-NimbleGen
价    格: 询价
更新时间: 2018/5/21 15:46:06
浏览人数:19965
诚信指数:962点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海康成生物工程有限公司
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产品详细描述

aCGH 比较基因组杂交芯片

     异常的DNA拷贝数变化(CNV)是许多人类疾病(如癌症、遗传性疾病、心血管疾病)的一种重要分子机制。作为疾病的一项生物标志,染色体水平的缺失、扩增等变化已成为许多疾病研究的热点,然而传统的方法(比如G显带,FISH,CGH等)存在操作繁琐,分辨率低等问题,难以提供变异区段的具体信息。
    基于芯片技术的比较基因组杂交(aCGH :array-based Comparative Genomic Hybridization)平台解决了上述问题。通过在一张芯片上用标记不同荧光素的样品(病例样品和对照样品)进行共杂交可检测样本基因组相对于对照基因组的DNA拷贝数变化(CNV),常用于肿瘤或遗传性疾病全基因组CNV检测,直观地表现出肿瘤及遗传性疾病基因组DNA在整个染色体组的缺失或扩增。对肿瘤而言缺失片段可能包含抑癌基因,而扩增片段则可能存在致癌基因。
 

康成生物为您提供aCGH全程技术服务,并且拥有丰富的实验经验。您只需要提供保存完好的组织、细胞或石蜡样本,康成技术服务人员就能为您完成实验操作,包括超声打断基因组、荧光标记、芯片杂交、图像采集和数据分析等,并为您提供完整的实验报告。

 
Agilent CGH芯片产品
    Agilent推出了不同覆盖度CGH芯片产品,便于不同需求的客户根据自身的需求选择合适的产品。Agilent的180K CGH芯片针对UCSC最新数据库设计探针,覆盖了人,大鼠,小鼠的整个基因组。探针长度为60 mer,可以确保Tm值均一化并且提供更好的信噪比和灵敏度。针对人的全基因组,Agilent还推出了1M超高密度aCGH芯片,单张芯片上有96万个覆盖全基因组的探针,探针平均间距缩小到2.1 kb,以外显子水平的分辨率对目标区域进行分析。利用Agilent CGH芯片平台已发表了多篇高质量论文,被收录在NatureScience等顶级科技期刊中。
 
产品目录号
物种
芯片格式
探针长度
探针平均间距
基因组版本
021529
1×1M
60mer
2.1 kb
hg18
021850
2×400K
60mer
5.3 kb
hg18
022060
4 ×180 K
60mer
13 kb
hg18
021924
8× 60K
60mer
41 kb
hg18
027414
小鼠
1×1M
60mer
1.8 kb
mm9
027411
小鼠
4 ×180 K
60mer
10.9 kb
mm9
027065
大鼠
1×1M
60mer
1.7 kb
rn4
027064
大鼠
4 x 180K
60mer
10.7 kb
rn4
 
Agilent还提供多个模式物种的CGH芯片,物种包括:鸡,牛,狗,猕猴,黑猩猩,水稻。
 
康成生物aCGH技术服务主要实验流程
    1. 样品超声打断基因组
待测样品(Test)和对照样品(Reference)基因组DNA样本超声剪切成低分子量片段;
    2. 荧光标记
对Test(Cy5)和Reference(Cy3) DNA样品进行标记。
    3. 芯片杂交
标记后的Test 和Reference DNA样品混合、变性后与CGH芯片进行共杂交。
    4. 图像采集和数据分析
使用芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数值型数据保存,使用专业商用分析软件对原始数据进行分析运算;
    5. 提供实验报告 包括详细的实验方法和芯片实验数据和图表:
    芯片扫描图: Cy3、Cy5荧光扫描图像;
    原始数据:探针的荧光信号强度原始数据。
    拷贝数发生变化的染色体区段报告:用专业软件分析所有拷贝数发生变化的区段(CNV)的染色体定位和变化倍数以及相关基因信息。

康成客户实例
----比较基因组杂交芯片(aCGH
The properties of tumor-initiating cells from a hepatocellular carcinoma patient’s primary and recurrent tumor. Carcinogenesis, 2009.
 
    肝癌是死亡率、复发率非常高的恶性肿瘤,目前对其复发的机制知之甚少。本文作者利用Hep-11(原发性肝癌)与Hep-12(复发性肝癌)两个细胞系进行肝癌复发的机制研究。首先利用aCGH(比较基因组杂交芯片)技术对两株细胞的遗传背景进行了比较,发现两者在许多染色体上有共同的缺失或者扩增区域,说明这两株细胞的来源相同。进而探究其分子机制,利用real-time PCR Array芯片技术对84个干细胞相关基因进行了高通量筛查,发现SOX2、Nanog、OCT4等基因都发生了显著变化,暗示它们可能会对肝癌复发产生重要影响。


 
 
 
 

上海康成生物工程有限公司 
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