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微卫星标记(microsatellite)

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产品名称: 微卫星标记(microsatellite)

英文名称: STR

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北京亿鸣复兴生物科技
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★服务描述:
微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(simple tandem repeats, STRs),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛。
微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。PCR扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,如荧光染色标记、银染或荧光染色(如EB)。微卫星存在于大多数生物的基因组,它们在基因组里均匀分布,所以被广泛得应用于遗传杂交育种和绘制染色体遗传图谱的标记物。高度多态的微卫星,可以用来在人群进行个体识别。



★服务内容:
我们提供客户PCR产物扫描及数据分析,针对客户特定的样本设计实验方案,包括荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记,荧光分子量 Marker 的选用等,并完成特定样本的STR分型服务。


★服务流程:
前期确认阶段:实验样本类型,数量,引物,签订实验合作合同;
实验阶段:DNA提取,PCR扩增,琼脂糖电泳检测,PAGE筛选批量扩增引物和可以进行混合检测的引物,批量PCR, ABI3700xl批量检测(内标为ROX500,Liz-500);
数据分析:和客户详细沟通,确认分析方案。品种分析,或群体分析。读取01矩阵or片段大小:聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP)、多态位点百分率(P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)、遗传分化度(Gst)等,利用NTSYS进行聚类分析。


★需要提供的信息:
新鲜植物组织(最好是黄化苗组织)或动物血液、组织材料,采样后立即放入液氮中速冻。
基因组DNA:要求完整,纯度高,无RNA污染,总量大于 50 μg。
提供已知的全长基因序列,GeneBank ID,详细背景资料,DNA/RNA来源、丰度等



★服务周期:
根据样品数量来协商,一般在20到30个工作日。


★服务说明:
1)我们抽取每对引物扩增样品的10%进行预实验以确定基因扫描上样量,如果客户样品扩增效率低或扩增效率不一致导致某些样品未检出信号,我公司仍收取检测费用。
2)为了保证实验进度,本公司采用批量上样的方法,如果预检测未发现异常,而实际检测后发现异常(如大量样本未扩出或扩增效率低等情况),我们会及时通知客户,由客户决定是否继续检测,之前产生的检测费用由客户承担。
3)根据客户提供的信息,分析软件自动判读结果。为保证结果的客观性,工作人员仅手动去掉Pull up峰,染料峰。如客户要求工作人员进行人工判别,工作人员可以据经验向客户提出意见,此意见仅供参考,公司不为此承担任何责任。
4)客户提供基因组DNA样品时,应保证样品的密封性。如需样品返还请提前说明,如无特殊说明,一个月后本公司将处理掉样本,如客户提前未说明返还导致样品丢失本公司不负责任。
5)对客户的实验结果本公司保留30天,客户如有问题请在30天内提出,30天后将删除试验结果。



★其他服务项目:



★项目一般流程:



联系人:杜经理
电话:18611436921
地址:北京市海淀区学院路35号院世宁大厦14层1405室