生命科学服务 农业领域案例分析北京博奥晶典生物技术有限公司

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技术服务信息

服务名称:生命科学服务 农业领域案例分析
服务类别:其它服务 - 其它
价格:1.0元
允许参观:允许参与实验
所在区域:北京.北京
更新时间:2019/9/5 8:58:00
浏览人数:978
诚信指数:1916点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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北京博奥晶典生物技术有限公司
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北京市亦庄经济技术开发区科创六街88号,亦庄生物医药园C座
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101111
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400-9968-999
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联系人:
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所在区域:
北京·北京
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技术服务详细描述

 

产品与服务


支持客户发表文章

博奥晶典协助众多客户连续在Nature、Cell、 Science 杂志上发表了多篇高水平文章,发表在国际顶尖期刊上
的文章包括 Nature 及子刊34 篇, Cell 及子刊 14 篇, Science1 篇。
截至2017 年2 月,共支持客户发表SCI 文章1500 余篇,影响因子累计超过6500 分。
◆ 影响因子>5 的文章超过360 篇
◆ 影响因子>10 的文章超过70 篇
◆ 影响因子>20 的文章超过32 篇




选择育种及品种差异性研究
        为了能够发挥品种优势,发掘不同品种的品种潜力,更好地发挥品种特性在选择育种中的优势作用,为农业育种提供优质原料及适当的育种方式,有效的节约育种周期并提高品种质量;农业科研中常采用高通量生物学技术对品种差异性进行特定分子水平研究,并对品种的品质特点分子进行对比分析,从而筛选出能够影响分子育种并产生关键作用的分子,进而指导分子育种的杂交筛选,达到高效育种的目的。
       近年来针对分子选择育种的SNP 芯片技术由于其高通量、操作简单、结果准确、重复性高、数据信息含量丰富及超高的性价比,逐步取代传统的SSR(微卫星)等育种手段,成为未来育种技术发展方向之一。


Maize HapMap2 Identifies Extant Variation from a Genome in Flux


研究思路>
       利用群体遗传学分析模型,研究玉米属103 个野生型及家养型品种之间以及该种属与另一姐妹属(Tripsacum )的SNP 位点差异。发现两品种之间、种属之间的基因组结构差异非常显著,并且该差异主要出现在重要性状相关的SNP 位点之处。LD 分析显示Tripsacum 的基因可以通过transposon(转座子)而不是异源多倍体发现。玉米属种内基因的差异可能是由染色体knob content 调节。玉米与Tripsacum 种属间的关键基因存在极大重叠,这意味着Tripsacum 的耐寒及耐药抗性可以很好地应用于玉米属中。

Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces
























抗逆抗病机制研究
      在进行作物品种改良时通常是通过增强作物对害虫或环境条件( 例如干旱或土壤盐渍) 的抵抗力、或是通过开发更高产的植物来增加作物的产量。因此,研究农作物的抗逆抗病机制,进而筛选出更耐受极端条件、产量更高的经济作物就显得尤为重要。



研究内容>

      中国科学院遗传与发育生物学研究所鲍时来研究组以模式植物拟南芥为材料,利用遗传学和生物化学等研究手段,发现在正常生长条件下,SKB1 结合于RD29A、RD29B 等胁迫响应基因及开花抑制基因FLC 的染色质区并催化这些区域的组蛋白H4R3 的对称性双甲基化,抑制这些基因的表达,以促进开花等发育过程;在受到盐胁迫时,SKB1从这些基因的染色质区离开,增加SKB1 介导的mRNA 剪接复合体中心蛋白LSM4 的对称性双甲基化,从而使胁迫响应基因及开花抑制基因被诱导表达,同时增强了非生物胁迫响应基因及开花等生长发育相关基因的剪接。






基因表达调控机理研究

     植物基因的表达是以一定的时间和空间顺序进行调控的,有的基因只在某种细胞的特异发育阶段表达,有的则只在细胞受到某种环境刺激后才表达;正是因为这种表达调控特异性,对其调控机理的研究一直是农业科研基础研究的热点问题。
     随着测序及芯片等高通量技术的发展和完善,基因表达调控的研究逐渐趋向于应用模式生物进行表达调控网络的系统构建和全面分析,这种方法能够得到更为完整的表达调控信息,尤其适用于研究目的基因改变引起的下游逐级信号传递过程。



研究内容>
       科研人员发现与芽阶段不断减少不同,水稻在幼期后,幼叶到老叶过程中miR156 的水平是不断增加的。然而,miR156 的目标基因OsSPL 在叶子发育过程中要么一直高表达,要么没改变。通过表达谱芯片比较了野生型的早衰老叶、晚发育幼叶,以及miR156 过表达植株,发现3008 个基因受到miR156 过表达影响。结果显示随着叶片发育周期,miR156 调控的基因变化具有时间性,而过表达miR156 则减弱了这些表达差异。同时7 个保守的植物miRNA 表达量也随着叶片发育周期呈相应变化,而过表达miR156 同样减弱了这些改变。总之,miR156 在调控叶片发育阶段的基因时间性表达方面起着至关重要的作用。

       研究应用的Affmetrix GeneChip rice Genome Array 服务在博奥生物有限公司完成。







组织器官发育特异性研究
       在植物的发育过程中,某些基因产物可能只出现在特定细胞、组织、器官或特定发育时期。例如:种子蛋白、叶绿体蛋白、参与***形成的酶和果实贮藏物质,倾向于在植物体内特定器官或发育的特定时期合成。研究农作物基因型的器官发育,探讨细胞、组织、器官发育与分化的特异性,能够为农作物离体培养的优异TCR(Tissue Culture Response) 基因型的性状相关选择提供理论依据,同时获得对幼胚培养中器官发生途径的量性认识,更利于优势物种的选择育种。



研究内容>
      为了研究植物修复过程中的分子机制,研究团队利用拟南芥鉴定出了一组愈伤组织中的全能细胞(C1)和非全能细胞(C2),并对其愈伤形成和芽再生过程中的差异miRNA 进行了研究。研究发现miR160a 在芽诱导培养基培养10 天后表达下调,在C1 细胞中其表达丰度较C2 细胞明显降低,而miR160a 过表达则妨碍了培养细胞芽的再生过程。miR160a 的靶基因ARF10 可以大幅度提高芽的再生能力,并且其表达集中在芽和叶的生长点。在芽再生早期野生型的ARF10 的表达量低于ARF10 转基因细胞,这与miR160a 的表达模式相反。因此,miR160a 和ARF10 同时参与了体外培养芽再生过程。
      该研究应用了植物miRNA 芯片服务在博奥生物有限公司完成。





测序与定制芯片联合应用
●预制型芯片:主要针对已经测序的模式生物,基因组序列已知,已有商业化芯片产品;
●定制型芯片:主要针对刚刚测序完毕或还未完全测序的物种;
●测序+ 定制芯片: 稀有物种、基因组/转录组信息不完善,无序列或位点数据库;先测序获得序列或位点信息,然后再按照一定的原则进行筛选序列或位点,进行探针设计,定制芯片。
   由于农林畜牧及微生物,大部分物种基因组/ 转录组信息不完善,因此,越来越多的客户倾向于进行测序后,挑选针对特定研究目的的靶向探针进行芯片定制。



研究内容>
       为了研究烟草性状相关的miRNA,采用了Solexa 技术对烟草的根、茎、叶、花四种组织进行了small RNA 测序,共发现84 个miRNA,51 个为烟草特有。并通过定制烟草miRNA 芯片,研究了组织特异性表达的miRNA、上中下部叶特异表达miRNA 和打顶前后差异表达miRNA,为了解miRNA 参与的烟草性状调控做了探索性的工作。该研究应用的小RNA 测序和miRNA 芯片定制服务都在博奥生物有限公司完成。









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