m1A RNA 甲基化测序上海云序生物科技有限公司

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技术服务信息

服务名称:m1A RNA 甲基化测序
服务类别:分子生物学服务 - DNA测序服务
价格:咨询:021-64878766
允许参观:协商决定
所在区域:上海.上海
更新时间:2017-12-15 10:13:00
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海云序生物科技有限公司
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技术服务详细描述

m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。


与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,首先需要用LC-MS/MS对m1A甲基化水平定量。抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。此外,利用m1A会导致错配的特性,对抗体富集下来的片段用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化,对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果,捕捉碱基突变的信号,来实现m1A甲基化修饰位点单碱基分辨率的鉴定。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段,将m1A RNA甲基化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,不仅计算出样本中m1A甲基化程度,同时还可找到m1A甲基化修饰的具体位点信息。

图注:云序生物m1ARNA甲基化测序实验流程

云序生物 m1ARNA甲基化测序产品


云序优势

技术优势:

单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰

特异性高

m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段

一站式服务:

客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程

专业的生物信息学分析:

云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求

云序生物技术服务列表

1. 测序服务

转录组表观遗传组基因组
真核生物原核生物
miRNA测序细菌sRNA测序(h)MeDIP测序目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序
lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序
环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序
mRNA测序原核De novo转录组测序RNA pull down宏基因组测序
降解组测序 RIP测序 
转录组测序 (m5C)RNA甲基化测序 
De novo转录组测序 (m6A)RNA甲基化测序 
  (m1A)RNA甲基化测序  

2.生信服务&PCR技术服务

生信服务实时定量PCR服务
转录组表观遗传组基因组联合分析
环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片
lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCR
mRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCR
microRNA分析   miRNA实时定量PCR
    mRNA实时定量PCR

  


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