SNP芯片/SNP检测/SNP分型威斯腾生物

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技术服务信息

服务名称:SNP芯片/SNP检测/SNP分型
服务类别:分子生物学服务 - SNP检测服务
价格:欢迎来电详询023-65316016,023—65316556
允许参观:允许参与实验
所在区域:重庆.重庆
更新时间:2019/5/21 9:03:00
浏览人数:163
服务商:威斯腾生物
诚信指数:1678点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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威斯腾生物
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重庆高新区生物医药研发产业园D栋
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4006756758
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技术服务详细描述

SNP芯片/SNP检测/SNP分型

SNP芯片
SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变(包括转换、颠换、缺失和插入)而导致的 DNA 序列多态性。SNP 检测已广泛应用于疾病易感基因鉴定、标记开发和基因定位、群体遗传学研究等多个领域中。

Illumina 的高通量 SNP 芯片是基于 Infinium 技术的全基因组 SNP 检测芯片(Infinium™ Whole Genome Genotyping),适用于全基因组 SNP 分型研究及基因拷贝数变化研究,一张芯片检测几十万标签 SNP 位点,提供大规模疾病基因扫描。

技术特点
独特的位点设计:采用 HAPMAP 数据库中已经公布的 TagSNP 设计,具有无可比拟的覆盖优势
芯片形式灵活多样:可同时检测 4、8 或 12 个样本,还可以增加定制位点
高通量密度:可检测高达 500 万的 SNP 位点
较高的成功率和准确性:
等位基因特异性延伸保证高质量的实验结果
定制灵活:任意物种、任意位点随意组合,除 SNP 外,还可以针对拷贝数变异(CNV)进行设计

SNP检测

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)是指基因组上单个核苷酸的变异,人类基因组平均每1000个就有一个SNP。它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变,使得群体之间和个体之间产生了差异。其中转换和颠换发生频率较高,转换是指同型碱基之间的转换,即嘌呤与嘌呤、嘧***与嘧***间;颠换是指发生在嘌呤与嘧***之间的替换。事实上转换的发生频率占多数,且CG序列上出现的SNP最为频繁,而且多是C转换为T,原因是CG中的C常因为甲基化自发地脱氨基后即成为T。

技术应用

SNP作为第三代遗传标记,在复杂疾病的基因定位、关联分析、个体疾病易感性分析与药物基因组学的研究中发辉了重要的作用。除医学研究外,SNP已逐渐涉及遗传学、生态学、作物育种众多邻域。研究对象也由人类扩展到有重要经济价值和研究价值的动植物、微生物等。


SNP分型检测技术服务

SNP(single nucleotide polymophism),即单核苷酸多态,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因。SNP在人基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点,是继微卫星之后的第三代遗传标记。有些SNP位点还会影响基因的功能,从而导致生物性状改变甚至致病。 

SNP研究包括SNP发现(discovery)、SNP验证(validation)以及SNP筛选(Screening or Scoring)。广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面,将逐渐取代微卫星而成为新一代的分子生物学标记)。和疾病相关基因的研究,在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。SNP的分布不均匀,非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。虽然SNP不及RFLP和短串联重复序列STR标记变异程度高,但由于数量巨大,分布频密,因此就整体而言,其多态性要高得多。  

1. 直接测序法进行SNP分析
 在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。通常情况下,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。
1)操作流程:

  • 样品基因组DNA提取
  • 根据不同的区域进行引物设计、合成
  • 对所有样品进行基因扩增并纯化
  • 测序
  • 统计与分析

2)样品要求:
血液样品:样品为EDTA抗凝或枸椽酸钠抗凝,样品量大于1ml,样品采集后于-20℃或-80℃保存;
组织样品:样品可以为新鲜组织(最好-80℃保存)、石蜡包埋组织或95%乙醇中固定的组织,组织量大于50μg 细胞、菌液等。
3)提供结果:
实验流程、电泳图、测序图谱、SNP基因型统计结果等。

2.Taqman探针法(定量PCR)
客户根据实验要求挑选出SNPs后,提交给我们进行引物与探针设计与合成。上述工作完成后,客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验。
1)技术特点:
适合位点数量少,样本通量高的检测(每个位点需要合成两条探针,探针合成费用高);
应用ABI7900、ABI7500定量PCR仪进行定量检测;
操作简便,只需一步 PCR 反应,无须进行纯化和预处理,直接上机检测;
结果清晰,软件分析结果界面友好,标出了每个样本的基因型及荧光强度,非常直观;
可采用ABI合成的探针或国产探针。
2)样品要求:同测序法。
3)提供结果:实验流程、电泳图、定量PCR结果、统计分析结果等。

威斯腾实验服务流程



威斯腾生物服务项目

分子生物学检测蛋白质与免疫学动物实验
实时荧光定量PCR单克隆抗体制备帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP多克隆抗体制备抑郁症动物模型
ELISA(酶联免疫吸附法)技术Western-blot 实验服务脊髓损伤模型
生化指标检测蛋白双向电泳实验服务脑外损伤模型
双荧光素酶报告基因检测原核蛋白表达纯化骨神经损伤模型
染色质免疫共沉淀(ChIP真核蛋白表达纯化心肌缺血模型
GST pull DownITRAQ定量蛋白质组学心力衰竭模型
SLAC蛋白组学肺动脉高血压动物模型
高血压模型
病毒包装实验课题整体外包粥样动脉硬化模型
过表达/干扰慢病毒包装纯化整体课题外包大脑中动脉阻塞模型
过表达/干扰腺病毒包装纯化细胞整体实验外包慢性之气管炎模型
逆转录病毒包装纯化动物整体实验外包过敏性哮喘模型
腺相关病毒包装纯化肺炎大鼠模型
肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片原代细胞培养肝纤维化模型
细胞因子芯片骨髓间充质干细胞培养胆结石模型
BioPlex悬浮芯片脂肪干细胞培养急性胰腺炎模型
生长因子芯片心肌成纤维细胞培养急性肾衰竭模型
炎症因子芯片软骨细胞培养体内血栓模型
血管生成因子芯片血管内皮细胞培养关节炎模型
凋亡因子芯片神经元细胞培养I型和II型糖尿病模型
趋化因子芯片内皮组细胞原代培养裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人类蛋白组芯片基因编辑动物
电生理相关服务动物整体实验服务
膜片钳实验
细胞生物学检测高通量测序代谢组学
细胞原代培养mRNA测序气相色谱GC/MS
MTT检测LncRNA测序液相色谱LC/MS
细胞凋亡检测全基因组测序核磁共震NMR
细胞周期检测RNA-Seq测序
细胞克隆形成实验外显子测序影像学相关实验
Transwell细胞迁移/侵袭16s扩增子测序Micro-CT
流式分选Small RNA测序小动物活体成像
CCK8/XTT检测宏基因组测序核磁共振
台盼蓝检测细胞活性单细胞测序PET-CT
药物筛选细胞学实验circleRNA测序
细胞粘附性检测甲基化测序基因编辑动物
细胞划痕实验条件性敲除小鼠/大鼠
细胞生物学整体实验全基因敲除小鼠/大鼠
细胞成管实验
病理检测CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入基因芯片
扫描电镜基因定点突变细胞系LncRNA芯片
透射电镜单基因敲除细胞系miRNA芯片
HE染色多基因敲除细胞系mRNA芯片
免疫组化目的基因敲入细胞系甲基化芯片(限人和小鼠来源样本)
Tunel(原位末端凋亡法)检测报告基因敲入细胞系SNP芯片(限人和小鼠来源样本)
激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除细胞系
免疫荧光
Masson染色CRISPR/Cas9动物敲除/敲入科研设计指导&文章评估/润色
原位杂交基因敲除大鼠/小鼠科研文献论著翻译
荧光原位杂交基因敲入大鼠/小鼠论文翻译润色服务
特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等)临床实验/科研实验设计方案指导
行为学检测药物筛选服务项目药效学评价
旷场实验高通量自动药物筛选平台抗肿瘤药物药效学评价
重复性刻板行为检测细胞高内涵药物筛选平台心血管系统药物药效学评价
动物跑台检测蛋白质组学靶标研发平台泌尿系统药物药效学评价
强迫游泳分子药理研究平台内分泌系统药物药效学评价
生物膜片钳药物筛选平台抗炎免疫药物药效学评价
常规药物体外筛选

【本平台合作项目】

分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除&敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测, 、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、SiRNA与纳米载药、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!
【全国免费热线】400-675-6758
【电话】023-65316016,023-65316556
【邮箱】china-western@163.com
【官网网址】www.cqwestern.com
【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园D栋2楼

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