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10X_Genomics单细胞转录组分析

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产品名称： 10X_Genomics单细胞转录组分析

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10X_Genomics单细胞转录组常规分析CellRanger(v3版) - 10X单细胞转录组初步分析1）测序数据质控：
测序错误率分布检测; A/T/G/C 含量分布检测; 测序数据过滤，去除接头、污染和低质量 reads
2）单样本比对分析：
reads 和参考基因组比对及统计分析; reads 在基因组上功能区域的分布统计; 测序饱和度分析; 细胞总数、全细胞表达的基因总数统计; 单细胞测序 reads 中位数统计; 单细胞表达基因中位数统计		按样收费
Seurat (v3版) - 单细胞数据深入分析1）单样本细胞聚类分析：
单样本 PCA 降维分析; 单样本 tSNE 可视化分析; 单样本 UMAP 可视化分析
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细胞群间差异基因分析		按次收费
Seurat (v3版) - 单细胞数据去批次效应的整合分析1）去除样本之间的批次效应；
2）多样本细胞聚类分析：
多样本 PCA 降维分析; 多样本 tSNE 可视化分析; 多样本 UMAP 可视化分析
3）差异表达基因分析：
细胞群间差异基因分析		按次收费，不限样本数
10X_Genomics单细胞转录组深度分析cellranger-popscle推断细胞来源详见斑斓多组学平台结果展示；使用cellranger-popscle推断细胞来源，例如区分一例骨髓移植样本中的细胞哪些来自供体，哪些来自受体。按次收费，不限样本数
cellranger-demuxlet推测细胞来源详见斑斓多组学平台结果展示；使用cellranger-popscle推断细胞来源，例如区分一例骨髓移植样本中的细胞哪些来自供体，哪些来自受体，该流程需额外的供受体全外显子组数据支持，并能获得更为准确的预测结果。按次收费，不限样本数
Monocle3细胞轨迹及差异表达分析详见斑斓多组学平台结果展示；拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测，并根据细胞的类型、时态等计算差异表达，获得相关marker基因等按次收费，不限样本数
单细胞层级分化之SPADE分析流程详见斑斓多组学平台结果展示；拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测，并根据细胞的类型、时态等计算差异表达，获得相关marker基因等按次收费，不限样本数
Single cell trajectory analysis using PAGA详见斑斓多组学平台结果展示；拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测，并根据细胞的类型、时态等计算差异表达，获得相关marker基因等按次收费，不限样本数
Single-cell RNA-seq cell types Recognition详见斑斓多组学平台结果展示；细胞类型预测，根据流程集成的血细胞数据集，判断每个未知细胞的细胞类型按次收费，不限样本数
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