10X_Genomics单细胞转录组分析中科光华(西安)智能生物科技有限公司

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技术服务信息

服务名称:10X_Genomics单细胞转录组分析
服务类别:分子生物学服务 - 生物信息学服务
价格:600-2000元
允许参观:允许参与实验
所在区域:陕西.西安
更新时间:2021/3/5 16:28:00
浏览人数:470
诚信指数:5点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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中科光华(西安)智能生物科技有限公司
地址:
陕西省西安市国家民用航天产业基地航创路1123号启航创新园
邮编:
电话:
18909275696/029-88662595
传真:
029-88662595
联系人:
刘经理
所在区域:
陕西·西安
邮件:
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技术服务详细描述

分析大类分析条目分析内容收费标准
10X_Genomics单细胞转录组常规分析CellRanger(v3版) - 10X单细胞转录组初步分析1)测序数据质控:
测序错误率分布检测; A/T/G/C 含量分布检测; 测序数据过滤,去除接头、污染和低质量 reads
2)单样本比对分析:
reads 和参考基因组比对及统计分析; reads 在基因组上功能区域的分布统计; 测序饱和度分析; 细胞总数、全细胞表达的基因总数统计; 单细胞测序 reads 中位数统计; 单细胞表达基因中位数统计
按样收费
Seurat (v3版) - 单细胞数据深入分析1)单样本细胞聚类分析:
单样本 PCA 降维分析; 单样本 tSNE 可视化分析; 单样本 UMAP 可视化分析
2)差异表达基因分析:
细胞群间差异基因分析
按次收费
Seurat (v3版) - 单细胞数据去批次效应的整合分析1)去除样本之间的批次效应;
2)多样本细胞聚类分析:
多样本 PCA 降维分析; 多样本 tSNE 可视化分析; 多样本 UMAP 可视化分析
3)差异表达基因分析:
细胞群间差异基因分析
按次收费,不限样本数
10X_Genomics单细胞转录组深度分析cellranger-popscle推断细胞来源详见斑斓多组学平台结果展示;使用cellranger-popscle推断细胞来源,例如区分一例骨髓移植样本中的细胞哪些来自供体,哪些来自受体。按次收费,不限样本数
cellranger-demuxlet推测细胞来源详见斑斓多组学平台结果展示;使用cellranger-popscle推断细胞来源,例如区分一例骨髓移植样本中的细胞哪些来自供体,哪些来自受体,该流程需额外的供受体全外显子组数据支持,并能获得更为准确的预测结果。按次收费,不限样本数
Monocle3细胞轨迹及差异表达分析详见斑斓多组学平台结果展示;拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测,并根据细胞的类型、时态等计算差异表达,获得相关marker基因等按次收费,不限样本数
单细胞层级分化之SPADE分析流程详见斑斓多组学平台结果展示;拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测,并根据细胞的类型、时态等计算差异表达,获得相关marker基因等按次收费,不限样本数
Single cell trajectory analysis using PAGA详见斑斓多组学平台结果展示;拟时分析/轨迹分析/分化顺序预测,并根据细胞的类型、时态等计算差异表达,获得相关marker基因等按次收费,不限样本数
Single-cell RNA-seq cell types Recognition详见斑斓多组学平台结果展示;细胞类型预测,根据流程集成的血细胞数据集,判断每个未知细胞的细胞类型按次收费,不限样本数
10X_Genomics单细胞转录组个性化分析根据客户需求,定制化分析内容按需分析,可提供方案评估及个性化辅导按需评估

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