生物在线 - 让科研更便捷 :生命科学专业网,试剂,仪器,抗体,耗材在线查询

转录组测序、RNA测序 单细胞测序 chip-seq测序 外显子组测序、Hi-C全套 RNA-seq ChIp-seq ATAC-seq、蛋白质组学TRAQ北京科沿有道生物科技有限公司

技术服务信息

服务名称:转录组测序、RNA测序 单细胞测序 chip-seq测序 外显子组测序、Hi-C全套 RNA-seq ChIp-seq ATAC-seq、蛋白质组学TRAQ
服务类别:科研实验整体外包服务 - 整体实验服务外包
价格:1500元
允许参观:允许参与实验
所在区域:北京.北京
更新时间:2021/9/8 15:38:00
浏览人数:13
诚信指数:5点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
点此求购 我要咨询
生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

供应商联系卡

北京科沿有道生物科技有限公司
地址:
昌平区能源西路1号奇点中心3层
邮编:
102200
电话:
18201011950
传真:
18201011950
联系人:
所在区域:
北京·北京
邮件:
公司展台:
扫一扫,关注我们

技术服务详细描述

Hi-C 测序市场宣传资料

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。

(引自Pueschel R, Coraggio F, et al. From single genes to entire genomes: the search for a function of nuclear organization. Development , 2016 , 143 (6) :910

该论文主要介绍了一种新的染色体构象捕获技术(DLO Hi-C),此技术信噪比高,质量控制于早期,为解析基因组三维结构提供了一种新型、高效、经济的研究方法。科沿有道现推出了10万个细胞水平的Hi-C建库,实现低起始量的Hi-C建库专业化和标准生信分析服务。

DLO Hi-C技术使全基因组染色体构象捕获实验的成本大大的降低,同时简化了实验步骤,使得实验成功率显著提高,对辅助基因组组装、解析基因组远程调控元件的功能、理解疾病易感位点以及检测染色体结构变异有着重要的意义。

 

 

一、DLO Hi-C服务流程:

交联 环化连接 测序、分析

特点:在测序量更少情况下,染色质结构分析数据更多,简化文库构建过程,提升建库成功率。

二、技术优势:

● 微量细胞建库:正常建库与生信分析的样本量可低至10万个核

● 高成功率:细胞样本文库构建成功率几乎为100%

● 建库周期短:只需执行两轮简单的消化和连接步骤即可获得高质量的文库。

● 数据更准确:测序前质检,确保数据准确性

● 分辨率更高:在测序数据量更少的情况下,互作矩阵分辨率更高,染色质结构分析得到的数据也更多

● 较高的信噪比:使用多种措施来减少噪音,保证高质量的数据输出,分析更准确

● 量身定制个性化分析方案:提供DLO Hi-C的标准分析外,更注重与RNA-SeqChIP-SeqATAC-Seq和甲基化等多组学表观遗传分析,提供个性化的生信分析方案

三、研究思路:

Hi-C可以与RNA-SeqChIP-SeqATAC-Seq等数据进行联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。


ATAC-seq市场宣传资料

ATAC-seqAssay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是美国Stanford大学的William Greenleaf教授在2013年所研发的一种全新方法,利用DNA转座酶结合高通量测序技术,来研究染色体的可进入性。

ATAC-seq是一种创新的表观遗传学研究技术,该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。

在理解这个技术之前,需要先认识一下染色体的结构。

染色体主要由DNA和蛋白质组成,每一条染色单体由单个线性DNA分子组成,细胞核中的DNA是经过高度有序的包装,包装分为多个水平,核小体核心颗粒(nucleosome core particle)、染色小体(chromatosome)30 nm水平染色质纤丝(30 nm fibre)和高于30 nm水平的染色体包装。

染色体的组成

(引自Annunziato, A.DNA Packaging: Nucleosomes and Chromatin. Nature Education, 2008,1(1):26

DNA的复制,基因的转录,需要将DNA的高级结构解开,这部分打开的染色质,称为开放染色质(open chromatin),而打开的染色质,就允许一些调控蛋白(比如转录因子和辅因子)与之结合。染色质的这种特性,叫做染色质的可及性(chromatin accessibility)。

ATAC-seq示意图

(引自William J.Greenleaf, Jason D. Buenrostro, et al. Transposition of native chromatin for multimodal regulatory analysis and personal epigenomics. Nat Methods. 2013, 10(12): 12131218.

DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA,需要插入位点的染色质是开放的,否则就会被高级结构卡住。需要人为地将携带已知DNA序列标签的转座复合物(即带着测序标签的转座酶),加入到细胞核中,再利用已知序列的标签进行建库后测序,就知道哪些区域是开放染色质了,这也就是ATAC-seq的原理。

一、技术流程:

制备细胞悬液裂解细胞膜,获取细胞核采用Tn5进行酶切回收DNA片段,PCR扩增建库高通量测序大量的生信分析

二、技术应用:

1重大疾病发病机制:癌症、生殖系统、糖尿病等疾病发病机制

2药物相关研究:药物作用机制、新药研发、耐药性及敏感性研究

3潜在标志物预测:临床生物标志物发现、生物标志物功能研究

4染色体结构研究:染色体开发性图谱绘制、核小体定位预测、转录因子结合位点分析


iTRAQ定量蛋白质组学市场宣传资料

iTRAQisobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术,利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端和赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学中应用广泛的高通量筛选技术。

一、技术特点:

1自动化程度高:液质连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好;

2灵敏度高:分级分离,降低样品复杂度,检测出较低丰度蛋白;

3高通量:可同时对8样本(iTRAQ)10样本(TMT)进行分析,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析;

4结果可靠准确:定性与定量同步进行,同时得出鉴定和定量结果,重复样品间的蛋白表达量相关性高。

二、适用范围:

1药物作用靶点研究;        2疾病标志物筛选;

3植物胁迫/抗逆研究;        4作用机制研究;

5物种蛋白质草图构建。

三、服务流程:

接受订单及样品蛋白酶解iTRAQ标记样品混合HPLC分组分LC-MS/MS数据解析结果交付

四、客户提供:

1需比较的样品;

2样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

五、最终交付:

实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。

六、生物信息学分析内容包括:

1iTRAQ鉴定:包括鉴定结果统计、重复性分析、Unique肽段数分布、肽段长度分布、蛋白覆盖度分布;

2iTRAQ定量:包括定量信息统计、蛋白质丰度比(FC)分布、表达量层次聚类分析;

3蛋白质功能注释:包括GO注释、COG注释和Pathway代谢通路注释;

4差异蛋白的富集分析:包括差异蛋白的GO富集分析、差异蛋白的Pathway富集分析。

七、服务周期:

自送样起45个工作日。

八、如何订购:

咨询订购:请详细填写蛋白质组学项目信息咨询单信息后,发给相关项目经理


Label-free定量蛋白质组学市场宣传资料

Label-free是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关。因此,蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种,第一种spectrum counts类的非标记方法,发展比较早,已经形成多种定量算法。但是主要的原理是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。

一、技术特点:

1无需标记,操作简单;

2不受比较样品数限制;

3对实验操作稳定性、重复性要求高;

4准确性较标记定量略低;

5要求至少做三次技术重复或生物重复。

二、适用范围:

1适合大样本量的定量比较,对无法用标记定量实现的实验设计,用Label-free技术;

2药物作用靶点研究;

3疾病标志物筛选;

4植物胁迫/抗逆研究;

5作用机制研究;

6物种蛋白质草图构建;

7要求物种含有已完成全基因组测序或转录组测序注释的CDS信息。

三、服务流程:

接受订单及样品蛋白酶解HPLC分组分LC-MS/MS数据解析结果交付

生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

查看转录组测序、RNA测序 单细胞测序  chip-seq... 产品的用户还对以下产品感兴趣

  Affymetrix基因表达谱芯片服务   [供应商:上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心]
  博士课题/硕士课题/整体实验外包服务   [供应商:威斯腾生物]
  整体实验设计和实验技术外包服务   [供应商:上海锐赛生物技术有限公司]
  全基因组重测序   [供应商:上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心]
  临床实验/科研实验设计方案指导(课题承接)   [供应商:百奥迈科生物技术有限公司]
  蛋白质组学技术服务、生物技术药物分析   [供应商:北京正旦国际科技有限责任公司]
  miRNA芯片   [供应商:上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心]
  病毒包装   [供应商:赛业(广州)生物科技有限公司]
  克隆服务   [供应商:上海英骏生物技术有限公司]

ADVERTISEMENT

找不到您所需的产品,发布求购试试?

标题:*
描述:
姓名:*
Email:*
单位:*
电话:*
地址:*
邮编:
资料: 需要 不需要
报价: 需要 不需要