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甲基化测序(RRBS)广州市锐博生物科技有限公司

技术服务信息

服务名称:甲基化测序(RRBS)
服务类别:分子生物学服务 - DNA测序服务
价格:询价
允许参观:允许参与实验
所在区域:广东.广州
更新时间:2017/2/22 16:31:00
浏览人数:2432
诚信指数:69点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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供应商联系卡

广州市锐博生物科技有限公司
地址:
广州科学城科学大道182号· 创新大厦C3栋 13层
邮编:
510663
电话:
020-32290221
传真:
020-32290137
联系人:
朱先生
所在区域:
广东·广州
邮件:
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技术服务详细描述

测序简介

RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing) 利用限制性内切酶对基因组进行酶切,可以极大幅度的提高CpG区域的测序深度,与全基因组甲基化测序相比,测序量将大大减少,并在CpG岛、启动子区域和增强子元件区域达到更高精度的分辨率。同时,利用RRBS可以实现多个样本的比对基因组分析。

 
测序简介

精确度高:在其覆盖范围内可达到单碱基分辨率。

重复性好: 多样本的覆盖区域重复性可达到85%-95%,适用于多样本间的差异分析。

检测范围广: 覆盖全基因组范围内超过5百万个CpG位点。

性价比高:测序区域更有针对性,数据利用率更高。

 
实验流程

 
测序模式

HiSeq 2500双端2X100bp测序模式

5G clean data

 

信息分析

标准数据分析

1、数据质量统计和过滤

2、甲基化序列比对分析

3、覆盖度和测序深度统计

4、计算C碱基的甲基化水平

5、DNA甲基化信号在基因组的分布

6、DNA甲基化信号的基因组元件注释

7、DNA甲基化图谱

8、差异甲基化区域(DMR)分析

个性化数据分析

1、promoter差异甲基化的基因功能富集分析

2、promoter差异甲基化的生物功能富集分析

* 分析详细内容请向当地销售工程师索取

 

案例分析

研究人员利用RRBS甲基化测序技术,获得了在人和鼠多能干细胞中DNA甲基化的分布图。该分布图显示了基因组中甲基化随细胞发育(当原态胚胎干细胞发育为始发态胚胎干细胞时)而变化的特定位点。该实验结果建立了一条通往再生医学、个体iPS细胞疾病模型构建、体外体内研究人类胚胎发育研究的新途径。

 

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