大豆 355K SNP芯片北京博奥晶典生物技术有限公司

技术服务信息

服务名称:大豆 355K SNP芯片
服务类别:生物芯片服务 - 生物芯片处理和分析服务
价格:1.0元
允许参观:允许参与实验
所在区域:北京.北京
更新时间:2019/12/3 15:31:00
浏览人数:892
诚信指数:1976点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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北京博奥晶典生物技术有限公司
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北京市亦庄经济技术开发区科创六街88号,亦庄生物医药园C座
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400-9968-999
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联系人:
市场部
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北京·北京
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技术服务详细描述

 大豆是重要的粮食和油料作物。SNP是第三代分子遗传标记,SNP芯片具有价格低、通量高、分析简单等特点,是分子育种领域的重要工具。南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/国家大豆改良中心与博奥晶典生物技术有限公司合作,运用Affymetrix® Axiom平台联合开发了大豆 355KSNP芯片。该芯片具有高密度、低成本、全覆盖、多用途的特点,可以应用于大豆种质资源基因型鉴定、品种鉴定、遗传多样性分析、大豆农艺性状的全基因组关联分析(GWAS)研究、功能基因/QTL定位与克隆、大豆分子设计育种(分子标记辅助选择、全基因组选择育种等)等。


产品优势


产品参数

  • 全基因组范围覆盖

355,595个SNP位点从600多万个SNP筛选获得

  • 标记分布均匀

标记均匀覆盖大豆20条染色体,93.6% SNP标记间隔小于9 Kb,标记间的平均物理距离为3.3 Kb


数据结果展示

  • 群体结构分析和L D 衰减分析

  • 人工选择信号分析

  • G W A S 分析



应用案例

大豆粒重性状GWAS研究

  • 研究背景

      大豆的驯化是在人类致力于开发高产品系的强烈的定向选择下形成。追溯大豆的驯化历史、鉴定驯化相关基因需要进一步研究。本文开发了一个高通量大豆355KSNP芯片,并利用这一芯片来研究367个大豆品系的遗传变异模式,包括105个野生型和262个栽培品系。群体遗传分析表明,栽培大豆可能起源于中国北部和中部,传播到其它区域,在此过程中伴随着粒重的逐渐增加。对大豆进行全基因组范围的人工选择检测,发现了选择性清除的信号,包括调控驯化相关农艺性状(如粒重)的基因。为了进一步鉴定粒重相关基因,对多个环境下的野生和栽培大豆进行了全基因组关联研究。发现在20号染色体上的一个强连锁不平衡区域与栽培大豆的粒重显著相关。综上,这些发现将为大豆基因组育种提供重要基础,并促进大豆功能基因组研究。
       Sci Rep. 2016 Feb 9;6:20728. 影响因子:5.228

  • 研究路线



经典参考文献
Wang, Jet al. Development and application of a novel genome-wide SNP array reveals domestication history in soybean.Sci Rep.2016 Feb9;6:20728.

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