Illumina SNP基因分型检测北京博奥晶典生物技术有限公司

金牌供应商 

技术服务信息

服务名称:Illumina SNP基因分型检测
服务类别:生物芯片服务 - 生物芯片制备服务
价格:询价
允许参观:不允许参与实验
所在区域:北京.北京
更新时间:2018/5/8 18:49:00
浏览人数:15756
诚信指数:1672点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
点此求购 我要咨询
生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

供应商联系卡

北京博奥晶典生物技术有限公司
地址:
北京市亦庄经济技术开发区科创六街88号,亦庄生物医药园C座
邮编:
101111
电话:
010-69002900
传真:
联系人:
市场部
所在区域:
北京·北京
邮件:
公司展台:

技术服务详细描述

 

Illumina SNP基因分型检测

简介

  SNP(单核苷酸多态性)分析是目前研究基因功能,寻找与疾病相关的基因及其突变位点,进行遗传连锁分析的一种重要分析手段。Illumina SNP Genotyping采用微珠芯片技术(BeadArray), 可对全基因组或特定SNP位点进行分析,其检测质量可靠,得到业界所广泛认可。该平台也是HapMap计划(国际人类基因组单体型图计划)的主要技术平台,在HapMap第一阶段数据中,约70%都出自Illumina平台。Illumina SNP Genotyping平台分为Infinium和GoldenGate两大系列产品,均可提供预制和半定制以及定制的芯片。Infinium技术流程适合于多位点的中高通量(30万到500万个位点)的全基因组分型;GoldenGate技术流程适合于SNP位点较少的中低通量(96到3072个位点)基因组分型。

Infinium技术原理

  Illumina全基因组分型芯片采用Infinium技术,检测中采用全基因组扩增方式,无需PCR反应,不依赖限制性内切酶,SNP位点的选择上可以完全根据基因组情况来选择;gDNA样品在芯片杂交后通过等位基因特异性的单碱基延伸来完成,确保高质量的实验数据。Illumina Infinium基因分型技术包括全基因组SNP芯片和iSelect自定义全基因组SNP芯片。

   ill snp-in

1.准备500ng-750ng gDNA,利用NaOH变性。
2.将gDNA恒温过夜,进行基因组全扩增,该过程不会产生等位基因偏向性扩增。
3.扩增产物用随机内切酶酶切片断化。
4.乙醇沉淀DNA,重新悬浮。
5-6.杂交:将DNA片段与芯片进行杂交(准备芯片,在毛细管流通的小室进行杂交),芯片的微珠上连接有50-mers长度特异性捕获探针,gDNA酶切后产物与探针互补序列结合,杂交过夜。
7.单碱基延伸:双色荧光染料标记的核苷酸底物(T和C)在捕获探针上进行单碱基延伸。只有与gDNA发生互补结合的探针才能得到延伸。
8.芯片清洗后进行扫描。
9.利用软件判读分型结果,SNP位点通过两种荧光颜色读取区分。

 

Infinium技术优势

独特的位点选择和设计:优先采用全世界公认的HapMap数据库中已经公布的TagSNP设计,具有更好的统计能力,可使研究者用尽可能少的样本发现SNP与疾病的相关性。

超高通量的密度:可检测30万-500万个SNP位点。

高质量的实验数据:无需PCR技术,不依赖限制性内切酶,在SNP位点的选择上可完全依据基因组情况来选择,芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成,保证了高质量的实验数据。

完整的SNP和CNV分析方案:Illumina的GenomeStudio分析软件包提供了完整的拷贝数工具和Genome Viewer。

芯片形式灵活多样:通过在SNP位点通量和样本通量间取舍,可同时检测2,4或12个样本,增加样品通量。

应用广泛:Genotyping平台被大量用于肿瘤,心血管疾病,精神疾病,各种免疫性疾病等复杂疾病的研究,药物遗传学研究及病禽畜的育种研究。

定制灵活:可以根据位点数目以及样品数目,灵活的选择不同的芯片格式进行定制检测。

GoldenGate技术原理

  GoldenGate芯片技术是理想的中等通量基因分型检测的解决方案。GoldenGate检测芯片采用了特殊的设计:不同SNP位点的差异通过OPA探针组(oligonucleotide pool assay, OPA)的位点特异性延伸和连接而实现。GoldenGate芯片是一种tag芯片,芯片的微珠上仅带有地址序列而没有基因组的对应序列,杂交发生在地址序列和其互补序列进行间接杂交完成,而与基因组序列无关。目前GoldenGate芯片可以在单管内实现最高1536个位点多重检测。

       ill snp-gold

1.将gDNA和固相磁性小珠相连。

2.将待检测DNA样品加入预先根据SNP位点设计的探针组OPA(每组Oligo包括P1,P2,和P3)。

3.通过等位基因特异性延伸和连接酶连接得到一段包含该SNP位点的片断。同时该片断带有一段特殊设计的地址序列。

4-5.该片断进行通用引物PCR扩增,并荧光标记(Cy3,Cy5和纯化。

6.杂交:PCR产物上芯片进行杂交,芯片的微珠上连接有地址序列(Address)的互补序列,通过地址序列完成杂交。

7-8.芯片清洗和扫描芯片。

9.软件自动判读分型结果。

GoldenGate技术优势

实验成功率高:所有的地址序列都经过特殊设计,具有近似的杂交温度,退火温度以及CG含量稳定等特点,杂交效率很高,检测成功率一般>99%。

实验重复性高:基于微珠芯片以及GoldenGate检测独特的设计:每个SNP位点有30倍的微珠重复,杂交在地址序列间发生等特点,检测重复性>99.7%。

高度灵活:客户可根据需要检查的样本量和SNP位点数量来确定使用不同格式的芯片(universal-12,universal-16,universal-32,每张芯片进行12,16,32个样本的检测,可针对384,768或1536个SNP位点进行探针的设计。

实验过程全程质控:内参微珠,芯片中设计了几百个内参微珠对实验过程进行***,如:样品污染,延伸特异性等。GenomeStudio基因分型分析软件自动报告实验***结果。

芯片生产100%QC质控:微珠芯片生产过程中专利的解码技术,质控能深入到每张芯片上每个微珠每个特性,保证数据的可靠性和重复性。

高性价比:以平均较低的价格完成SNP位点的验证,方法经典可靠,人类HapMap计划大部分数据来自于该技术。

定制灵活:您只需提供位点信息,Illumina即可为您进行探针设计及成功率评分,非常适合位点数从几十到几千的中等通量基因分型研究。

产品列表

产品名称

Markers数目及位点选择

样本/芯片

HumanCytoSNP-12

30万个遗传标记,广泛覆盖pericentromeric区(基因组结构中迅速改变的区域)、亚端粒区和性染色体,特别还包括可检测400余个参与发育缺陷、智力迟钝和其他的结构性变化的基因相应探针

--

Human660w-Quad

大约65.8万个位点信息,其中55万TagSNP(HapMap数据库release 23)和10万个常见CNV marker。

4

HumanOmniExpress

超过70万个位点,HapMap phase1-3(MAF>5%)

12

HumanOmni1-Quad

超过113万个markers,1000 Genomes Project Piolt 和HapMap phase 1-3(MAF ≥ 5%)

4

HumanOmni1S

超过100万个markers,1000 Genomes Project Piolt(MAF>2.5%)

--

HumanOmni2.5

约250万个markers,1000 Genomes Project Piolt(MAF>2.5%)和HapMap1-3

4

HumanOmni2.5S

约250万个markers,1 kGP Full Project(MAF≥1%)

--

HumanOmni5

约500万个markers,HapMap phase 1-3和1kGP Full Project(MAF≥1%)

--

Human1M-duo

120万左右个markers,增加了疾病相关的SNP位点,灵活的选择一些基因组编码区高密度的SNP位点。

2

HumanExon 510S-Duo

约51万个tag SNP,其中33万偏重于基因中央的SNPs和nsSNPs,和新近报道的CNV区域,药物代谢有关的基因区域和MHC区域。

2

牛全基因组分型芯片服务BovineSNP50v2

54,609万个探针,平均间距为51.5kb,平均探针间距49.4kb,与USDA-ARS,University of Missouri和the University of Alberta合作开发

24

犬全基因组分型芯片服务CanineHD

17万个markers,每Mb平均多于70个标记物,与LUPA合作开发,信息来自于CanFam2.0参考序列

12

犬全基因组分型芯片服务CanineSNP20

22,362万个SNPs探针,每Mb平均有8个SNPs,与Board研究院iSelect项目合作,信息来源CanFam2.02完全组装

12

羊全基因组SNP分型芯片服务OvineSNP50

超过54,241个探针,平均每46kb有一个标记,作为国际羊基因组计划的一部分,与AgResearch,Baylor UCSC, CSIRO, 和 USDA合作开发。

12

猪全基因组SNP分型芯片服务PorcineSNP60

62,163万个探针,平均每40kb有一个标记,iSelect项目,与爱荷华州立大学,伊利诺斯大学,剑桥大学,瓦格宁根大学合作开发。

12

马全基因组SNP分型芯片服务EquineSNP50

54,602个SNP位点,平均43.2kb的探针间距覆盖31个常染色体,均一分布在15个品种马匹的全基因组序列上。iSelect项目,与国际Equine Genome Mapping Workshop 和the Morris Animal Foundation's Equine Genome Consortium合作开发。

12

玉米基因分型芯片服务MaizeSNP50

56,110个SNP探针,信息来源玉米B73系基因组序列,与TraitGenetics,The French Institute for Agricultural Research(INRA),和Syngenta合作开发。

24

癌症SNP芯片Cancer SNP Panel

超过400个肿瘤相关基因的1421个SNP位点,信息来源于美国国家癌症研究所Cancer Genome Anatomy Project SNP500 Cancer数据库。http://snp500cancer.nci.nih.gov/。可在Universal BeadChips或Universal Array Matrix上使用。

12,16,32 or 96

主要组织相容性研究芯片服务MHC Panel Set

2,360 个SNP位点,基因密度区域间隔 4Mb 的 SNP 标记,检测6号染色体短臂(p)160个基因,40%基因编码免疫系统蛋白。包括MHC Exon-Centric和MHC Mapping。

2╳96

人类连锁分析芯片HumanLinkage-V panel Set

>6000个SNP位点,两个SNP平均遗传间距0.64cM,物理间距482Kb,比STR具有更高的密度。可在Universal BeadChips或Universal Array Matrix上使用。

12,16,32 or 96

小鼠低密度连锁分析芯片Mouse LD Linkage Panel

377个位点,平均每27Mb区域覆盖4个SNP位点。适用于N2和F2代遗传杂交的小鼠,可进行QTL(quantitative trait loci)图谱定位。可在Universal BeadChips或Universal Array Matrix上使用。

12,16,32 or 96

小鼠中密度连锁分析芯片Mouse MD Linkage Panel

1,449个位点,平均每5Mb区域覆盖3个SNP位点。适用于绘制转基因动物,同类品系,基因敲除的动物和互交品系的遗传图谱。可在Universal BeadChips或Universal Array Matrix上使用。

12,16,32 or 96

DNA质控芯片(DNA test panel)

360 个SNP位点,用于在开展大位点实验之前对样品进行质控。

--

 

 

 

生物在线声明:以上所展示的信息由企业自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布企业负责。生物在线对此不承担任何保证责任。

查看Illumina SNP基因分型检测 产品的用户还对以下产品感兴趣

  Affymetrix mRNA表达谱芯片服务   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  全基因组表达谱基因芯片技术服务   [供应商:上海康成生物工程有限公司]
  Illumina SNP基因分型检测   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  Agilent mRNA表达谱芯片检测   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  单克隆抗体制备   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  定制蛋白芯片检测   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  Illumina RNA-Seq表达谱分析   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]
  系统的生物芯片研究解决方案   [供应商:上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心]
  SBC基因表达谱芯片服务   [供应商:上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心]
  Agilent aCGH芯片检测   [供应商:北京博奥晶典生物技术有限公司]

ADVERTISEMENT

找不到您所需的产品,发布求购试试?

标题:*
描述:
姓名:*
Email:*
单位:*
电话:*
地址:*
邮编:
资料: 需要 不需要
报价: 需要 不需要